Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
1184
Ученые из Великобритании, Китая, Дании, США, Южной Кореи и России заново секвенировали и полностью упорядочили фрагменты генома масайского жирафа. Этот представитель африканской фауны — самое высокое животное в мире, чей вид относится к исчезающим.
При помощи новейших методов секвенирования и сборки новосибирские ученые из НГУ и Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН занимались оптимизацией генома, укладывая прочитанные фрагменты последовательно на хромосомы. Полученные данные были опубликованы в крупном научном журнале GigaScience (импакт-фактор — 7,267), куда попадают наборы данных и результаты исследований в области биологических наук.
Масайский жираф, благодаря своим размерам и росту, имеет уникальные анатомические и физиологические особенности. Они давно представляют интерес для ученых из различных областей исследования. Изучение генома жирафа Килиманджаро имеет высокую значимость: это не только позволит понять молекулярную основу уникальных адаптивных черт жирафов, но и поможет облегчить эволюционный анализ других жвачных животных.
— Сборка генома масайского жирафа представляла собой так называемую «кучу рваного текста» без начала и конца, как это обычно бывает для геномов других видов. В результате четырехлетней работы у нас получилась «книга про жирафа», где определены последовательности для 20 тысяч генов. Дальше будут попытки понять, как эти гены работают, например, за счет каких изменений в них сердце жирафа способно гонять кровь на такую высоту, обходясь без инфарктов. Кроме того, жирафы — совершенно отдельная группа парнокопытных, и мы выяснили в деталях, чем их геном отличается от геномов коров, оленей и других изученных видов отряда, — рассказал руководитель научного направления ИМКБ СО РАН, инженер лаборатории структурной, функциональной и сравнительной геномики Факультета естественных наук НГУ, доктор биологических наук Александр Графодатский.
В ИМКБ СО РАН собрана уникальная коллекция живых клеток сотен видов животных планеты, в том числе африканской фауны. Сборка подобного генома — это важнейший ресурс, который может помочь сохранить масайского жирафа. Его численность сократилась на 52 % за последние годы.
— В мире сейчас есть несколько проектов нового секвенирования геномов позвоночных. От России только наш коллектив принимает в них участие. Естественно, на первом этапе выбирают зверей «звучащих», жираф — один из них, — утверждает Александр Графодатский.
Источники
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
Ученые улучшили сборку генома исчезающего вида жирафа
За вымирающий вид жирафа борются новосибирские ученые
Ученые улучшили сборку генома исчезающего вида жирафа
Ученые улучшили сборку генома исчезающего вида жирафа
Новосибирские биологи упорядочили генома исчезающего жирафа
Новосибирские биологи упорядочили генома исчезающего жирафа
Новосибирские биологи упорядочили генома исчезающего жирафа
Новосибирские ученые борются за редкий вид жирафа
Новосибирские ученые борются за редкий вид жирафа
Новосибирские ученые борются за редкий вид жирафа
Новосибирские биологи борются за редкий вид жирафа
Новосибирские ученые борются за редкий вид жирафа
Новосибирские ученые спасают шестиметрового жирафа
Новосибирские ученые спасают шестиметрового жирафа
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
Самое высокое существо спасают новосибирские ученые
Самое высокое существо спасают новосибирские ученые
Самое высокое существо спасают новосибирские ученые
Самое высокое существо спасают новосибирские ученые
Самое высокое существо спасают новосибирские ученые
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа - "Общество"
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
Почему жираф большой. Геном африканского парнокопытного собирали всем миром
Похожие новости
-
18/03/2020
Новосибирские ученые помогут прочитать нарушенную ДНК
Исследователи Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН и Новосибирского государственного университета работают над коктейлем из белков, который способен помочь в расшифровке деградировавшей ДНК — это важно, в частности, для палеогенетиков и судмедэкспертов. 769
-
27/06/2017
Новосибирские биологи стали участниками нового геномного проекта
Ученые Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН примут участие в международном проекте по секвенированию генома всех видов эукариотов, то есть живых организмов, клетки которых содержат ядро - об этом рассказал заместитель директора ИМКБ СО РАН по научной работе доктор биологических наук Александр Сергеевич Графодатский на открытии II Всероссийской конференции "Высокопроизводительное секвенирование в геномике". 1633
-
17/06/2016
Академик Игорь Жимулёв: под диктовку генов
В этом году Институту молекулярной и клеточной биологии СО РАН исполняется пять лет. За это время удалось существенно продвинуть уже ведущиеся исследования и организовать перспективные новые. О современном состоянии ИМКБ рассказывает его директор академик Игорь Фёдорович Жимулёв. 2200
-
16/04/2018
Ученые нашли новый белок-регулятор развития древесины
Группа ученых из пяти стран, включая Россию, исследовала генетическую регуляцию деления стволовых клеток в стебле растений и обнаружила ранее неизвестный механизм контроля роста древесины фитогормоном ауксином. 1189
-
22/03/2019
Новосибирские биологи совместно с иностранными коллегами изучили общего предка коровы и кита
Ученые из Англии, США, Китая и России определили все основные перестройки хромосом и геномов китопарнокопытных во всех круциальных (подверженных эволюционной трансформации участках хромосом) точках их эволюции. 1219
-
14/06/2018
В СО РАН продолжается обсуждение проектов развития исследовательской инфраструктуры ННЦ
Проект Сибирского национального центра высокопроизводительных вычислений, обработки и хранения данных (СНЦ ВВОД) представил заместитель председателя СО РАН академик Павел Владимирович Логачёв. «В современных исследованиях во всех областях знаний научные данные являются ключевым драйвером, — подчеркнул координатор проекта. 1594
-
22/02/2019
Что происходит на фармацевтическом рынке России?
Учредитель ГК «SFM», экс-банкир Андрей Бекарев анализирует ситуацию на фармацевтическом рынке, а также уровень поддержки государством и чиновниками местного производителя. — Андрей Александрович, по вашим оценкам, созданы ли сегодня в России благоприятные условия для развития отечественных производителей?— Российская экономика выстроена странно — реального спроса на продукцию российского производства я сегодня не вижу. 1087
-
24/05/2017
CAR-клетки: идеальные солдаты против рака
Лечение рака зачастую включает в себя методы с опасными последствиями: химио- и лучевую терапию, пересадку костного мозга... Однако с заболеванием можно бороться посредством клеток собственного организма — в том числе, чтобы минимизировать побочные эффекты. 4726
-
05/12/2016
Сибирские генетики и управление фотосинтезом
Ученые Новосибирского государственного университета и Института цитологии и генетики СО РАН отвечают на вопрос о том, как на генетическом уровне регулируется синтез и распределение хлорофилла в разных органах растений, исследуя геномы обычного ячменя и ячменя частичного альбиноса, у которого нарушена выработка хлорофилла. 3194
-
03/08/2020
Биоцентр СО РАН: биотехнологии выходят на новый уровень
Проект Биоцентра Сибирского отделения РАН находится на согласовании в Минэкономразвития РФ.Он будет создан для продвижения на рынок разработок биологических институтов Академгородка, создания биотех-стартапов, развития клеточной медицины, синтетической биологии и импортозамещения, проблема которого особенно остро встала в этом году в связи с пандемией коронавируса. 296