​Российские ученые разработали первое в мире бесплатное программное обеспечение Quanfima для 3D-визуализации и анализа биоматериалов, которые участвуют в регенерации тканей. Программа позволяет ученым по всему миру совершенствовать этот процесс. Результаты исследований опубликованы в журнале PLoS One.

Работа велась в составе международной научной группы. Разработкой программирования занимался сотрудник технологического института Карлсруэ (Германия) Роман Шкарин. Томские ученые предоставили модельные материалы для исследований — полимерный скаффолд и гибридный полимерный скаффолд.

"Необходимость разработки подобного программного обеспечения была обусловлена отсутствием бесплатного продукта, позволяющего проводить анализ волокон в трехмерном пространстве. При этом у ряда зарубежных научных групп есть коммерческие продукты, чей функционал схож с нашей программой, но они не находятся в открытом доступе", — рассказал один из авторов исследования, директор научно-исследовательского центра ТПУ "Физическое материаловедение и композитные материалы" Роман Сурменев.

По словам ученого композитные трехмерные скаффолды (материалы с различной волокнистой структурой и добавками) способствуют заживлению тканей. Их размещают в дефектных местах, например, в переломах, где они становятся каркасом для новых клеток. Для анализа скаффолдов уже существуют методы визуализации, но создание их 3D-модели, остается сложной задачей из-за различного диаметра волокон (от микро- до наноразмеров) и состава. Это тормозит их внедрение в биомедицину. Новая бесплатная программа ускорит этот процесс.

"В настоящее время ПО Quanfima ("Quantitative Analysis of Fibrous Materials") уже готово и его можно скачать по ссылке. Наша программа облегчает трехмерную визуализацию и статистический анализ волокнистых биоматериалов, у нее удобный и простой интерфейс. Также Quanfima может выполнять как 2D, так и 3D-анализ данных, что выгодно отличает его от аналогов", — уточнил Сурменев.

Ученые уже протестировали ПО, проанализировав данные рентгеновской томографии.

"Полученные результаты показывают, что разработанное программное обеспечение поможет другим ученым, которые проводят аналогичные нашим исследования, анализировать волокнистую структуру любых скаффолодов, в том числе и гибридных", — подчеркнул ученый, уточнив, что в планах разработчиков — дальнейшее усовершенствование программного продукта с расширением функционала.

Источники

В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
РИА Новости, 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
Profi-news.ru, 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов - новости на сегодня 13.08.2019
News2world.net, 13/08/2019
Первый бесплатный ресурс для анализа биоматериалов создан в России
НьюИнформ (newinform.com), 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
Новости@Rambler.ru, 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
3news.ru, 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
Новости РУ (новости-ру.рф), 13/08/2019
Российские ученые создали первое доступное ПО, которое поможет восстанавливать ткани
Поиск (poisknews.ru), 13/08/2019
Ученые ТПУ и Германии создали общедоступное ПО для биомедицины
РИА Томск (riatomsk.ru), 13/08/2019
Ученые ТПУ и Германии создали общедоступное ПО для биомедицины
Новости России (news-life.ru), 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
Российский фонд фундаментальных исследований (rfbr.ru), 13/08/2019
ПО российских ученых поможет анализировать структуры скаффолдов
Индикатор (indicator.ru), 14/08/2019
ПО российских ученых поможет анализировать структуры скаффолдов
Новости@Rambler.ru, 13/08/2019
ПО российских ученых поможет анализировать структуры скаффолдов
SMIonline (so-l.ru), 13/08/2019
Ученые из ТПУ и Германии разработали первое доступное для всех ПО для анализа структуры скаффолдов
Служба новостей ТПУ (news.tpu.ru), 14/08/2019
Регенерацию поврежденных тканей можно изучить в формате 3D
Информбюро 20.35 (ntinews.ru), 14/08/2019
ПО российских ученых поможет анализировать структуры скаффолдов
Nanonewsnet.ru, 17/08/2019
Ученые ТПУ и Германии разработали первое общедоступное ПО для анализа биомедицинских материалов
Научная Россия (scientificrussia.ru), 26/08/2019
Ученые ТПУ и Германии разработали первое общедоступное ПО для анализа биомедицинских материалов
Nanonewsnet.ru, 28/08/2019

Похожие новости