Проект «Вычислительная платформа для филогенетического анализа соматической эволюции» («Computational platform for phylogenetic analysis of somatic evolution») под руководством выпускника Механико-математического факультета НГУ, заведующего лабораторией анализа биологических данных Университета Отаго (Новая Зеландия), доктора математических наук Александра Гаврюшкина получил поддержку фонда Endeavour. Работу фонда координирует Министерство бизнеса Новой Зеландии. Максимальный размер гранта в разделе Smart Ideas (финансирование проекта обусловлено большим потенциалом к созданию прогрессивной и рискованной технологии с существенным экономическим влиянием) — 1 000 000 новозеландских долларов. Именно такую сумму получили на развитие проекта Александр Гаврюшкин и его команда.

Endeavour Fund — это один из самых больших научных фондов в Новой Зеландии. Максимальный размер гранта в разделе Research Programmes фактически не ограничен. Фонд нацелен на финансирование прорывных идей, в том числе и в фундаментальной науке, с большим потенциалом оказать значительное влияние на экономику страны в будущем.


— На данный момент мы создали proof of concept — математическую модель и ее компьютерную реализацию для реконструкции соматической эволюции раковых клеток. Предварительные результаты показывают, что наш метод имеет хороший потенциал для создания приложения, способного помогать онкологам точнее определять стадию рака, время и место инициализации заболевания, историю появления и развития метастаз, их количество. Это проект с большим риском и большим потенциалом — в точности такой, какие MBIE Endeavour Smart Ideas хотят финансировать. В рамках этого проекта мы сможем быстро проверить наши идеи на их жизнеспособность, — отметил Александр Гаврюшкин.


В настоящее время филогенетика (область биологической систематики, которая занимается выявлением и прояснением эволюционных взаимоотношений видов жизни на Земле) предоставляет информацию, особенно важную в области эволюции, экологии, инфектологии и т. д. Новые технологии секвенирования расширяют сферу современной филогенетики, включая в перечень дисциплин биологию развития, соматические мутации, исследования онкологии с применением в сельском хозяйстве, биотехнологии и биомедицине. Проект «Computational platform for phylogenetic analysis of somatic evolution» позволит создать  вычислительную платформу, необходимую для обеспечения точного и широко применимого анализа молекулярных данных. Новые математические модели позволят более подробно исследовать динамику развития онкологических заболеваний. Для этого будут применены современные алгоритмические решения, например, онлайн-алгоритмы для анализа молекулярных данных.

Лаборатория анализа биологических данных Университета Отаго работает на стыке математики, компьютерных науки и геномики, занимается разработкой математических методов и алгоритмов для анализа молекулярных данных. Этот и более ранние гранты направлены на финансирование совместных исследований специалистов в области онкологии из университетов Отаго, Окленда и Австралийского национального университета.

— Перспективы, как и у любого фундаментального исследования, очень сложно предсказать. Как я сказал, это проект с большим риском, но если все, что мы планируем, удастся, то выгоды, в частности для онкологии, будут огромными. Что можно сейчас сказать точно — люди верят в нас, похоже, больше, чем мы сами в себя. Когда я представлял проект перед тем, как подать его в Министерство бизнеса, нами интересовались инвесторы, которые сейчас рассматривают потенциал проекта с коммерческой точки зрения. Для меня же лично это совершенно потрясающая возможность проверить чрезвычайно смелую идею и разобраться немного лучше в том, какие математические и алгоритмические проблемы возникают при попытках ответа на фундаментальные биологические вопросы, которые в современном мире невозможны без анализа огромных массивов молекулярной даты, — рассказал Александр Гаврюшкин. Исследователь отметил, что сейчас он и его коллеги находятся в активном поиске молодых ученых — аспирантов, кандидатов наук — способных и готовых работать в лаборатории над междисциплинарными проектами.


В 2017 году исследователь уже получал грант по программе Rutherford Discovery Fellowship от Королевского общества Новой Зеландии на создание лаборатории вычислительной биологии в Университете Отаго.

Похожие новости

  • 11/09/2019

    Специалисты Центра Мешалкина представили мировому научному сообществу новый метод лечения смертельного заболевания

    Результаты научных исследований Центра Мешалкина, посвященные применению оригинальной технологии хирургического лечения легочной гипертензии, вызвали большой интерес мирового научного сообщества. Доклады специалистов учреждения по данной тематике были признаны одними из лучших в программе ежегодного конгресса Европейского общества кардиологов (ESC Congress 2019).
    253
  • 27/05/2019

    Ученые Академгородка представили первые результаты лечения онкобольных при помощи БНЗТ

    ​О подтвержденной эффективности БНЗТ при различных типах злокачественных опухолей человека исследователи рассказали на конференции в Новосибирске. С докладом выступил завлабораторией БНЗТ Физического факультета НГУ, доктор физико-математических наук, доцент Сергей Таскаев.
    619
  • 04/08/2017

    Сибирский окружной медицинский центр ФМБА России и Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН заключили соглашении о совместной научной работе

    ​Основной задачей сотрудничества учреждения практического здравоохранения - ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России с ИМКБ СО РАН - научным учреждением, представляющим фундаментальную науку, является изучение молекулярно-генетических процессов, происходящих в ткани щитовидной железы при различных заболеваниях: опухолевых и неопухолевых процессах.
    1264
  • 19/02/2019

    Академический час для школьников: удивительные растения ЦСБС СО РАН

    ​19 февраля в 15.00 в Выставочном центре СО РАН состоится лекция кандидата биологических наук Анастасии Петровны Белановой (ЦСБС СО РАН) «Удивительные растения в дендрарии Центрального сибирского ботанического сада» для школьников 6-8 классов.
    510
  • 30/04/2019

    Учёные НГАУ работают над методами контроля численности колорадского жука

    ​Коллектив учёных Новосибирского ГАУ, под руководством доктора биологических наук, заведующего лабораторией биологической защиты растений и биотехнологий Ивана Михайловича Дубовского, получил грант Российского научного фонда на реализацию проекта "Использование РНК-интерференции для повышения эффективности методов контроля численности колорадского жука".
    1001
  • 10/03/2017

    Российские ученые разработали новое вещество против вируса гриппа на основе природных соединений

    ​Ученые из Новосибирского института органической химии имени Н.Н. Ворожцова Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирского государственного университета и Научно-исследовательского института гриппа в Санкт-Петербурге разработали новый продукт широкого спектра противовирусной активности, в основе которого лежат природные соединения: терпены и терпеноиды.
    2925
  • 09/11/2018

    Сибирские ученые обнаружили новый метод защиты от радиации

    Облучение лабораторных мышей рентгеновскими лучами привело к неожиданным результатам. Открытие совершили на стыке наук - физики-ядерщики работали вместе с генетиками. «Это иммунодефицитные мыши без шерсти, породу вывели специально для изучения опухоли», - рассказывают ученые.
    652
  • 11/09/2019

    11 сентября 2019 года в Новосибирске проходят заседания Объединенных ученых советов СО РАН по направлениям наук

    ​Повестки заседаний Объединенных ученых советов СО РАН 11 сентября 2019 года: По биологическим наукам второй день заседания состоится в 9:00 в конференц-зале Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.
    325
  • 19/10/2018

    Картофель: когда Россия избавится от импортозависимости по семенам?

    Картофель - "второй хлеб", без которого сибиряк долго прожить не сможет. Обязательно соскучится. Но почему уже с февраля на прилавках магазинов лежит не свой, а египетский? Сейчас, осенью, собрав урожай, сибиряки часть закладывают на семена для будущего года.
    614
  • 19/11/2018

    В Новосибирской области возобновят работу по созданию агробиотехнопарка

    ​Разработка проекта по созданию в Новосибирской области агробиотехнопарка для новых технологий в сельском хозяйстве возобновится с 2019 года. Проект был приостановлен из-за реорганизации Министерства образования и науки РФ, сообщил в пресс-центре ТАСС в Новосибирске заместитель директора по инновационной деятельности Института цитологии и генетики СО РАН Петр Куценогий.
    718