Проект «Вычислительная платформа для филогенетического анализа соматической эволюции» («Computational platform for phylogenetic analysis of somatic evolution») под руководством выпускника Механико-математического факультета НГУ, заведующего лабораторией анализа биологических данных Университета Отаго (Новая Зеландия), доктора математических наук Александра Гаврюшкина получил поддержку фонда Endeavour. Работу фонда координирует Министерство бизнеса Новой Зеландии. Максимальный размер гранта в разделе Smart Ideas (финансирование проекта обусловлено большим потенциалом к созданию прогрессивной и рискованной технологии с существенным экономическим влиянием) — 1 000 000 новозеландских долларов. Именно такую сумму получили на развитие проекта Александр Гаврюшкин и его команда.

Endeavour Fund — это один из самых больших научных фондов в Новой Зеландии. Максимальный размер гранта в разделе Research Programmes фактически не ограничен. Фонд нацелен на финансирование прорывных идей, в том числе и в фундаментальной науке, с большим потенциалом оказать значительное влияние на экономику страны в будущем.


— На данный момент мы создали proof of concept — математическую модель и ее компьютерную реализацию для реконструкции соматической эволюции раковых клеток. Предварительные результаты показывают, что наш метод имеет хороший потенциал для создания приложения, способного помогать онкологам точнее определять стадию рака, время и место инициализации заболевания, историю появления и развития метастаз, их количество. Это проект с большим риском и большим потенциалом — в точности такой, какие MBIE Endeavour Smart Ideas хотят финансировать. В рамках этого проекта мы сможем быстро проверить наши идеи на их жизнеспособность, — отметил Александр Гаврюшкин.


В настоящее время филогенетика (область биологической систематики, которая занимается выявлением и прояснением эволюционных взаимоотношений видов жизни на Земле) предоставляет информацию, особенно важную в области эволюции, экологии, инфектологии и т. д. Новые технологии секвенирования расширяют сферу современной филогенетики, включая в перечень дисциплин биологию развития, соматические мутации, исследования онкологии с применением в сельском хозяйстве, биотехнологии и биомедицине. Проект «Computational platform for phylogenetic analysis of somatic evolution» позволит создать  вычислительную платформу, необходимую для обеспечения точного и широко применимого анализа молекулярных данных. Новые математические модели позволят более подробно исследовать динамику развития онкологических заболеваний. Для этого будут применены современные алгоритмические решения, например, онлайн-алгоритмы для анализа молекулярных данных.

Лаборатория анализа биологических данных Университета Отаго работает на стыке математики, компьютерных науки и геномики, занимается разработкой математических методов и алгоритмов для анализа молекулярных данных. Этот и более ранние гранты направлены на финансирование совместных исследований специалистов в области онкологии из университетов Отаго, Окленда и Австралийского национального университета.

— Перспективы, как и у любого фундаментального исследования, очень сложно предсказать. Как я сказал, это проект с большим риском, но если все, что мы планируем, удастся, то выгоды, в частности для онкологии, будут огромными. Что можно сейчас сказать точно — люди верят в нас, похоже, больше, чем мы сами в себя. Когда я представлял проект перед тем, как подать его в Министерство бизнеса, нами интересовались инвесторы, которые сейчас рассматривают потенциал проекта с коммерческой точки зрения. Для меня же лично это совершенно потрясающая возможность проверить чрезвычайно смелую идею и разобраться немного лучше в том, какие математические и алгоритмические проблемы возникают при попытках ответа на фундаментальные биологические вопросы, которые в современном мире невозможны без анализа огромных массивов молекулярной даты, — рассказал Александр Гаврюшкин. Исследователь отметил, что сейчас он и его коллеги находятся в активном поиске молодых ученых — аспирантов, кандидатов наук — способных и готовых работать в лаборатории над междисциплинарными проектами.


В 2017 году исследователь уже получал грант по программе Rutherford Discovery Fellowship от Королевского общества Новой Зеландии на создание лаборатории вычислительной биологии в Университете Отаго.

Похожие новости

  • 04/08/2017

    Сибирский окружной медицинский центр ФМБА России и Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН заключили соглашении о совместной научной работе

    ​Основной задачей сотрудничества учреждения практического здравоохранения - ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России с ИМКБ СО РАН - научным учреждением, представляющим фундаментальную науку, является изучение молекулярно-генетических процессов, происходящих в ткани щитовидной железы при различных заболеваниях: опухолевых и неопухолевых процессах.
    1488
  • 06/02/2020

    В Институте почвоведения и агрохимии СО РАН прошла экскурсия для студентов НГАУ

    ​4 февраля 2020 года в рамках недели науки магистранты агрономического факультета под руководством доктора сельскохозяйственных наук, профессора Галеевой Любови Павловны приняли участие в научной экскурсии в лаборатории Института почвоведения и агрохимии СО РАН.
    342
  • 15/01/2020

    5-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений»

    5-я Международная конференция «Генофонд и селекция растений» пройдет в Новосибирске 1-3 апреля 2020 года. Основные направления работы конференции:Генофонд и селекция полевых культур.Генофонд и селекция овощных, плодово-ягодных, садово-парковых и декоративных растений.
    614
  • 10/03/2017

    Российские ученые разработали новое вещество против вируса гриппа на основе природных соединений

    ​Ученые из Новосибирского института органической химии имени Н.Н. Ворожцова Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирского государственного университета и Научно-исследовательского института гриппа в Санкт-Петербурге разработали новый продукт широкого спектра противовирусной активности, в основе которого лежат природные соединения: терпены и терпеноиды.
    3673
  • 14/05/2020

    7 вопросов о COVID-19

    ​Достигла ли Россия пика заболеваемости, какие лекарства сегодня считаются перспективными в лечении COVID-19, когда начнется массовое тестирование на антитела к новому коронавирусу в Новосибирской области и нужно ли носить маски на улице — на вопросы про это ответили сибирские специалисты.
    319
  • 18/05/2020

    Онлайн-трансляция конференции «НАУКА. МЕДИЦИНА. ИННОВАЦИИ»

    20 мая 2020 года в Новосибирске пройдет онлайн-трансляция III Научно-практической конференции «НАУКА. МЕДИЦИНА. ИННОВАЦИИ». Организаторами конференции являются Сибирское отделение РАН, Общественная палата НСО, Новосибирская областная ассоциация врачей, Комитет по здравоохранению НОО «ОПОРА России», ММА «МЁД», Агентство стратегических инициатив, а также медицинские и научные организации.
    449
  • 09/11/2018

    Сибирские ученые обнаружили новый метод защиты от радиации

    Облучение лабораторных мышей рентгеновскими лучами привело к неожиданным результатам. Открытие совершили на стыке наук - физики-ядерщики работали вместе с генетиками. «Это иммунодефицитные мыши без шерсти, породу вывели специально для изучения опухоли», - рассказывают ученые.
    957
  • 11/09/2019

    11 сентября 2019 года в Новосибирске проходят заседания Объединенных ученых советов СО РАН по направлениям наук

    ​Повестки заседаний Объединенных ученых советов СО РАН 11 сентября 2019 года: По биологическим наукам второй день заседания состоится в 9:00 в конференц-зале Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.
    654
  • 27/11/2019

    В Томске состоялась научная конференция «Генетика человека и патология: Актуальные проблемы клинической и молекулярной цитогенетики»

    ​С 20 по 22 ноября 2019 года в Томске проходила XII научная конференция «Генетика человека и патология: Актуальные проблемы клинической и молекулярной цитогенетики». Конференция объединила 230 участников из ведущих научных учреждений генетического профиля и медико-генетических консультаций.
    824
  • 19/10/2018

    Картофель: когда Россия избавится от импортозависимости по семенам?

    Картофель - "второй хлеб", без которого сибиряк долго прожить не сможет. Обязательно соскучится. Но почему уже с февраля на прилавках магазинов лежит не свой, а египетский? Сейчас, осенью, собрав урожай, сибиряки часть закладывают на семена для будущего года.
    868