​Российские ученые разработали первое в мире бесплатное программное обеспечение Quanfima для 3D-визуализации и анализа биоматериалов, которые участвуют в регенерации тканей. Программа позволяет ученым по всему миру совершенствовать этот процесс. Результаты исследований опубликованы в журнале PLoS One.

Работа велась в составе международной научной группы. Разработкой программирования занимался сотрудник технологического института Карлсруэ (Германия) Роман Шкарин. Томские ученые предоставили модельные материалы для исследований — полимерный скаффолд и гибридный полимерный скаффолд.

"Необходимость разработки подобного программного обеспечения была обусловлена отсутствием бесплатного продукта, позволяющего проводить анализ волокон в трехмерном пространстве. При этом у ряда зарубежных научных групп есть коммерческие продукты, чей функционал схож с нашей программой, но они не находятся в открытом доступе", — рассказал один из авторов исследования, директор научно-исследовательского центра ТПУ "Физическое материаловедение и композитные материалы" Роман Сурменев.

По словам ученого композитные трехмерные скаффолды (материалы с различной волокнистой структурой и добавками) способствуют заживлению тканей. Их размещают в дефектных местах, например, в переломах, где они становятся каркасом для новых клеток. Для анализа скаффолдов уже существуют методы визуализации, но создание их 3D-модели, остается сложной задачей из-за различного диаметра волокон (от микро- до наноразмеров) и состава. Это тормозит их внедрение в биомедицину. Новая бесплатная программа ускорит этот процесс.

"В настоящее время ПО Quanfima ("Quantitative Analysis of Fibrous Materials") уже готово и его можно скачать по ссылке. Наша программа облегчает трехмерную визуализацию и статистический анализ волокнистых биоматериалов, у нее удобный и простой интерфейс. Также Quanfima может выполнять как 2D, так и 3D-анализ данных, что выгодно отличает его от аналогов", — уточнил Сурменев.

Ученые уже протестировали ПО, проанализировав данные рентгеновской томографии.

"Полученные результаты показывают, что разработанное программное обеспечение поможет другим ученым, которые проводят аналогичные нашим исследования, анализировать волокнистую структуру любых скаффолодов, в том числе и гибридных", — подчеркнул ученый, уточнив, что в планах разработчиков — дальнейшее усовершенствование программного продукта с расширением функционала.

Источники

В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
РИА Новости, 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
Profi-news.ru, 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов - новости на сегодня 13.08.2019
News2world.net, 13/08/2019
Первый бесплатный ресурс для анализа биоматериалов создан в России
НьюИнформ (newinform.com), 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
Новости@Rambler.ru, 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
3news.ru, 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
Новости РУ (новости-ру.рф), 13/08/2019
Российские ученые создали первое доступное ПО, которое поможет восстанавливать ткани
Поиск (poisknews.ru), 13/08/2019
Ученые ТПУ и Германии создали общедоступное ПО для биомедицины
РИА Томск (riatomsk.ru), 13/08/2019
Ученые ТПУ и Германии создали общедоступное ПО для биомедицины
Новости России (news-life.ru), 13/08/2019
В России создан первый в мире бесплатный ресурс для анализа биоматериалов
Российский фонд фундаментальных исследований (rfbr.ru), 13/08/2019
ПО российских ученых поможет анализировать структуры скаффолдов
Индикатор (indicator.ru), 14/08/2019
ПО российских ученых поможет анализировать структуры скаффолдов
Новости@Rambler.ru, 13/08/2019
ПО российских ученых поможет анализировать структуры скаффолдов
SMIonline (so-l.ru), 13/08/2019
Ученые из ТПУ и Германии разработали первое доступное для всех ПО для анализа структуры скаффолдов
Служба новостей ТПУ (news.tpu.ru), 14/08/2019
Регенерацию поврежденных тканей можно изучить в формате 3D
Информбюро 20.35 (ntinews.ru), 14/08/2019
ПО российских ученых поможет анализировать структуры скаффолдов
Nanonewsnet.ru, 17/08/2019
Ученые ТПУ и Германии разработали первое общедоступное ПО для анализа биомедицинских материалов
Научная Россия (scientificrussia.ru), 26/08/2019
Ученые ТПУ и Германии разработали первое общедоступное ПО для анализа биомедицинских материалов
Nanonewsnet.ru, 28/08/2019

Похожие новости

  • 16/02/2021

    Для исследования атмосферы разработали мобильный лидар

    Ученые из Института оптики атмосферы имени В.Е. Зуева СО РАН создают первый в мире мобильный озоновый лидар для исследований влияния индустриальных выбросов на состав воздуха, наблюдения за вулканической активностью, а также изучения атмосферы Арктики.
    322
  • 24/12/2020

    Отчетная конференция Российского фонда фундаментальных исследований «Проекты молодых ученых Томской области в рамках реализации «Стратегии научно-технологического развития»

    Были представлены доклады по 2-м тематическим направлениям: «Фундаментальные исследования в технических науках, направленные на социально-экономическое развитие Томской области, и «Фундаментальные исследования в естественных науках и здравоохранении, направленные на развитие Томской области».
    445
  • 25/02/2020

    Ученые — о ближайшем будущем технологий

    ​Ученые из российских вузов Проекта 5–100 рассказали о том, каких прорывов и открытий в сфере своих научных интересов они ждут в ближайшее десятилетие. Мы отобрали прогнозы о развитии технологий, к которым стоит присмотреться бизнесу.
    1997
  • 14/01/2019

    Какие разработки томичей можно купить в магазине

    ​Томские инновации часто воспринимаются как нечто далекое от повседневных нужд. Но наши ученые успешно трудятся не только на оборонку, ракетно-космическую отрасль или, скажем, Большой адронный коллайдер, они также работают над созданием бытовой химии и косметики, лекарств и продукции для детей.
    1435
  • 07/11/2019

    Более 30 студентов и аспирантов ТПУ получили стипендии Президента и Правительства РФ

    ​В числе стипендиатов Президента РФ — четыре студента и семь аспирантов Томского политехнического университета. Стипендию Правительства России будут получать 13 студентов и семь аспирантов. В течение учебного года, помимо основной, они ежемесячно будут получать дополнительную стипендию.
    1245
  • 07/12/2020

    Единственное в России производство радиофармпрепарата с таллием-199 запущено на циклотроне ТПУ

    ​На циклотроне Томского политехнического университета запущено производство радиофармпрепарата «Таллия хлорид, 199Tl» на основе радиоактивного изотопа таллия-199. На сегодняшний день оно единственное в России.
    729
  • 24/11/2020

    Метод радиофизиков повысит выявление рака груди на ранних стадиях

    Ученые радиофизического факультета ТГУ предложили новый подход для обнаружения малоразмерных раковых образований молочной железы при зондировании радиоволнами СВЧ-диапазона. Метод позволит повысить вероятность выявления опухолей на ранней стадии образования без использования ионизирующего рентгеновского излучения.
    404
  • 19/02/2021

    "Купол" от ТУСУРа будет "разруливать" движение дронов и самолетов

    ​​Томский университет систем управления и радиоэлектроники (ТУСУР) и Фонд перспективных исследований в рамках проекта "Купол" создадут интеллектуальную систему управления опытным районом полетов беспилотных авиасистем (БАС) в Томской области, сообщил 18 февраля РИА Томск замгубернатора по экономике Андрей Антонов.
    226
  • 19/02/2021

    Данные учёных ТГУ помогут в обследовании пациентов с инсультом

    Учёные лаборатории нейробиологии ТГУ в ходе серии экспериментов, проведённых с использованием модели ишемического инсульта у крыс, получили новые данные о процессах, которые происходят в очаге поражения головного мозга.
    249
  • 17/02/2021

    Антивирусную лампу, представленную томскими учеными, планируется запустить в производство

    ​Антивирусную лампу, представленную томскими учеными, планируется запустить в производство. Напомним, разработанную ими антивирусную лампу нового типа представили ученые Института сильноточной электроники СО РАН, изготовили ее в НПЦ "Полюс".
    286