LifeCode-2018 прошел в Технопарке Академгородка. Непосредственно перед ним в НГУ была проведена Школа молодых ученых "Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул": больше половины участников хакатона посетили ее, что позволило им узнать о современных компьютерных методах в биологии и познакомиться друг с другом. На Школе были лекции и практикумы специалистов, а также стендовые и устные доклады участников - студентов, аспирантов и молодых ученых из разных городов.

На хакатоне LifeCode-2018 участникам было представлено несколько задач из разных областей биоинформатики. Каждая команда выбрала задачу себе по вкусу, и почти двое суток работала над ее решением. В конце мероприятия команды показали презентации своих работ. Жюри, состоящее из ученых и представителей бизнеса, выбрало победителей, которые получили подарки и денежные призы. Но г лавным результатом хакатона является то, что спустя три месяца многие команды продолжают развивать свои проекты.

Представитель команды, занявшей перовое место Иван Петрушин рассказал, что узнал о хакатоне и школе еще в феврале, когда первый раз участвовал в школе по биоинформатике в НГУ, посвященной геному человека. Его команда выбрала актуальную для Новосибирской области задачу - подбор ингибиторов белков вируса клещевого энцефалита с помощью докинга. Проект сейчас продолжается совместно с сотрудниками ГНЦ ВБ "Вектор", планируется экспериментальная проверка влияния найденных ингибиторов на вирус.

- Очень интересна оказалась тема моделирования биополимеров, взаимодействия их с малыми молекулами, что часто необходимо при дизайне лекарств. Лекторы школы познакомили с важными инструментами: Discovery Studio Visualizer, PyRx и UGENE. Особенно интересно было пообщаться непосредственно с разработчиками UGENE. Доклады участников здорово развили кругозор по теме, заставили взглянуть по-новому на некоторые методики. Хакатон - это отличный шанс поработать над реальной задачей, получить навык командной работы, почувствовать атмосферу драйва и увлеченности. Часто работа на хакатоне становится началом совместной работы, что порой важнее призов, - говорит Иван Петрушин.

Команда, занявшая второе место, решала задачу о разпознавании изображений, получающихся при анализе повреждений ДНК методом ДНК-комет. Дальнейшая работа над проектом идет совместно с норвежской компанией NorGenoTech, которая предложила эту задачу на хакатон и предоставила изображения для анализа.

- После хакатона я начала исследовать возможности программы 3Д-моделирования Blender по работе с пространственными структурами белков. Мое решение задачи по укладке амилоидных фибрилл, которое я представила на хакатоне, было еще предварительным. Сейчас я на планирую все сделать на более высоком уровне, и надеюсь, что вместе с товарищами по команде мы опубликуем статью, - отметила Зинаида Радькова, одна из участниц LifeCode-2018.

Команда, занявшая третье место, выбрала темой своего проекта работу с базой данных сплайсинговых вариантов белков. Автор задачи, Нина Опарина, работает в Стокгольмском университете. В начале июля она приезжала в Новосибирск и встретилась с участниками хакатона, чтобы обсудить развитие разработанного ими веб-сервиса и подготовку публикации в научный журнал.

Мероприятие проходило при поддержке Проекта 5-100.

Источники

Призеры хакатона LifeCode-2018 активно работают над проектами, представленными на мероприятии
Новосибирский государственный университет (nsu.ru), 20/08/2018

Похожие новости

  • 27/03/2017

    Новосибирские ученые создали материал, обеспечивающий 30 лет непрерывной работы химического реактора

    Ученые из Института ядерной физики (ИЯФ) СО РАН и Новосибирского государственного технического университета (НГТУ) создали новую технологию сплавления титана и тантала, в результате чего получили особо стойкий к коррозии и агрессивным средам материал.
    1474
  • 29/08/2018

    В Новосибирске собираются построить аэродинамическую трубу для изучения обледенения самолетов

    ​Аэродинамическую трубу для изучения процессов обледенения при взлете и посадке самолетов планируется построить в новосибирском Академгородке, сообщил агентству "Интерфакс-Сибирь" научный руководитель Института теоретической и прикладной механики им.
    296
  • 29/08/2018

    СО РАН и АО «ОДК-Авиадвигатель» подписали соглашение о сотрудничестве

    ​Ученые и конструкторы будут взаимодействовать в целях создания нового двигателя для будущего российского дальнемагистрального самолета. Управляющий директор-генеральный конструктор АО «ОДК-Авиадвигатель» член-корреспондент РАН Александр Александрович Иноземцев отметил, что подписанное соглашение — результат нескольких лет совместной работы с СО РАН.
    302
  • 27/08/2018

    Форум «Технопром» начал работу в Новосибирске

    Стартовал первый день работы VI Международного форума технологического развития "Технопром-2018" в МВК "Новосибирской области". 27 августа врио губернатора Новосибирской области Андрей Травников, министр науки и высшего образования Михаил Котюков, помощник Президента РФ Андрей Фурсенко и первый заместитель Председателя Госдумы РФ Александр Жуков примут участие в работе в первый день VI Международного форума технологического развития "Технопром-2018".
    499
  • 22/12/2017

    General Electric совершенствует аддитивные системы на основе газодинамического напыления

    ​Корпорация General Electric занимается разработкой масштабируемых 3D-принтеров на основе технологии холодного газодинамического напыления. Эти роботы плюются со скоростью в четыре Маха, выращивают металлические детали как будто из воздуха и учатся на собственных ошибках.
    536
  • 24/08/2018

    Академпарк пригласил предприятия ОПК к сотрудничеству

    ​Академпарк выступил с предложениями по развитию сотрудничества с предприятиями оборонно-промышленного комплекса на Международном военно-техническом форуме "Армия-2018", который проходит в Москве на площадке конгрессно-выставочного центра "Патриот", сообщили в пресс-службе Академпарка.
    153
  • 25/07/2018

    Новосибирский школьник изобрел гальваническую электростанцию

    ​Ученик специализированного учебно-научного центра Новосибирского государственного университета изобрел гальваническую электростанцию. Школьнику удалось разработать механизм, позволяющий вырабатывать недорогую электроэнергию при помощи воды.
    324
  • 24/05/2016

    Компания «Модульные системы Торнадо» займётся автоматизацией новосибирской ТЭЦ-5

    ​В октябре 2016 года на Новосибирской ТЭЦ-5 должна быть запущена новая багерная насосная станция (БНС) по откачке золосодержащих стоков. Компании «Модульные Системы Торнадо» поручена разработка и поставка программно-технического комплекса (ПТК)  АСУТП БНС.
    1602
  • 21/06/2017

    Для развития аддитивных технологий стоит объединяться

    ​Как следует развивать аддитивные технологии? Готова ли Российская Федерация отказаться от зарубежных поставок? Обсуждение этих и ряда других вопросов прошло на круглом столе в рамках Международного форума технологического развития "Технопром-2017".
    1062
  • 06/09/2017

    В Новосибирске расмотрели альтернативы «мусорному» концессионеру

    ​Альтернативные предложения по сбору и утилизации отходов были рассмотрены в рамках "Городской ассамблеи" в Новосибирске. Местные разработчики предложили новые современные технологии переработки ТКО.
    865