​Ученые из Великобритании, Китая, Дании, США, Южной Кореи и России заново секвенировали и полностью упорядочили фрагменты генома масайского жирафа. Этот представитель африканской фауны — самое высокое животное в мире, чей вид относится к исчезающим.

При помощи новейших методов секвенирования и сборки новосибирские ученые из НГУ и Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН занимались оптимизацией генома, укладывая прочитанные фрагменты последовательно на хромосомы. Полученные данные были опубликованы в крупном научном журнале GigaScience (импакт-фактор — 7,267), куда попадают наборы данных и результаты исследований в области биологических наук.

Масайский жираф, благодаря своим размерам и росту, имеет уникальные анатомические и физиологические особенности. Они давно представляют интерес для ученых из различных областей исследования. Изучение генома жирафа Килиманджаро имеет высокую значимость: это не только позволит понять молекулярную основу уникальных адаптивных черт жирафов, но и поможет облегчить эволюционный анализ других жвачных животных.

— Сборка генома масайского жирафа представляла собой так называемую «кучу рваного текста» без начала и конца, как это обычно бывает для геномов других видов. В результате четырехлетней работы у нас получилась «книга про жирафа», где определены последовательности для 20 тысяч генов. Дальше будут попытки понять, как эти гены работают, например, за счет каких изменений в них сердце жирафа способно гонять кровь на такую высоту, обходясь без инфарктов. Кроме того, жирафы — совершенно отдельная группа парнокопытных, и мы выяснили в деталях, чем их геном отличается от геномов коров, оленей и других изученных видов отряда, — рассказал руководитель научного направления ИМКБ СО РАН, инженер лаборатории структурной, функциональной и сравнительной геномики Факультета естественных наук НГУ, доктор биологических наук Александр Графодатский.

В ИМКБ СО РАН собрана уникальная коллекция живых клеток сотен видов животных планеты, в том числе африканской фауны. Сборка подобного генома — это важнейший ресурс, который может помочь сохранить масайского жирафа. Его численность сократилась на 52 % за последние годы.

— В мире сейчас есть несколько проектов нового секвенирования геномов позвоночных. От России только наш коллектив принимает в них участие. Естественно, на первом этапе выбирают зверей «звучащих», жираф — один из них, — утверждает Александр Графодатский.

Источники

Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
Новосибирский государственный университет (nsu.ru), 13/08/2019
Ученые улучшили сборку генома исчезающего вида жирафа
Навигатор (navigato.ru), 13/08/2019
За вымирающий вид жирафа борются новосибирские ученые
Ndn.info, 13/08/2019
Ученые улучшили сборку генома исчезающего вида жирафа
ИА Regnum, 13/08/2019
Ученые улучшили сборку генома исчезающего вида жирафа
The world news (theworldnews.net), 13/08/2019
Новосибирские биологи упорядочили генома исчезающего жирафа
HOLME SPACE (holme.ru), 13/08/2019
Новосибирские биологи упорядочили генома исчезающего жирафа
Новосибирские новости (nscn.ru), 13/08/2019
Новосибирские биологи упорядочили генома исчезающего жирафа
Московский Комсомолец # Новосибирск (novos.mk.ru), 13/08/2019
Новосибирские ученые борются за редкий вид жирафа
Seldon.News (news.myseldon.com), 14/08/2019
Новосибирские ученые борются за редкий вид жирафа
Сибкрай.ru (sibkray.ru), 14/08/2019
Новосибирские ученые борются за редкий вид жирафа
Академия новостей (academ.info), 14/08/2019
Новосибирские биологи борются за редкий вид жирафа
RuNews24 (runews24.ru), 14/08/2019
Новосибирские ученые борются за редкий вид жирафа
Новости регионов России (skoronovosti.ru), 14/08/2019
Новосибирские ученые спасают шестиметрового жирафа
Новости Новосибирска (novosibirsk-news.net), 14/08/2019
Новосибирские ученые спасают шестиметрового жирафа
Официальный сайт г. Новосибирск (nsknews.info), 14/08/2019
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
Наука в Сибири (sbras.info), 15/08/2019
Самое высокое существо спасают новосибирские ученые
Все новости Новосибирской области (vn.ru), 15/08/2019
Самое высокое существо спасают новосибирские ученые
Новости@Rambler.ru, 15/08/2019
Самое высокое существо спасают новосибирские ученые
Gorodskoyportal.ru/novosibirsk, 15/08/2019
Самое высокое существо спасают новосибирские ученые
Новости Новосибирска (novosibirsk-news.net), 15/08/2019
Самое высокое существо спасают новосибирские ученые
Elentur (elentur.com.ua), 15/08/2019
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа - "Общество"
Новости дня (novosti-dny.ru), 18/08/2019
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
Eadaily.com, 18/08/2019
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа
Seldon.News (news.myseldon.com), 18/08/2019

Похожие новости

  • 27/06/2017

    Новосибирские биологи стали участниками нового геномного проекта

    ​Ученые Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН примут участие в международном проекте по секвенированию генома всех видов эукариотов, то есть живых организмов, клетки которых содержат ядро - об этом рассказал заместитель директора ИМКБ СО РАН по научной работе доктор биологических наук Александр Сергеевич Графодатский на открытии II Всероссийской конференции "Высокопроизводительное секвенирование в геномике".
    1186
  • 17/06/2016

    Академик Игорь Жимулёв: под диктовку генов

    В этом году Институту молекулярной и клеточной биологии СО РАН исполняется пять лет. За это время удалось существенно продвинуть уже ведущиеся исследования и организовать перспективные новые. О современном состоянии ИМКБ рассказывает его директор академик Игорь Фёдорович Жимулёв​.
    1792
  • 04/08/2017

    Научная школа по молекулярной и клеточной биологии 2017 года

    5-6 октября 2017 года в ИМКБ СО РАН пройдет III Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. Она станет продолжением серии научно-образовательных мероприятий, проводимых в ИМКБ с 2010 года.
    1783
  • 16/04/2018

    Ученые нашли новый белок-регулятор развития древесины

    Группа ученых из пяти стран, включая Россию, исследовала генетическую регуляцию деления стволовых клеток в стебле растений и обнаружила ранее неизвестный механизм контроля роста древесины фитогормоном ауксином.
    696
  • 29/07/2015

    Новосибирские ученые исследуют механизм появления умственной отсталости

    Ученые из Новосибирского государственного университета проводят уникальные исследования по определению механизма и причин появления умственной отсталости человека.Новосибирские ученые под руководством Дмитрия Юдкина, научного сотрудника Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН и преподавателя НГУ, проводят исследования по определению механизма и причин появления cиндрома ломкой X-хромосомы.
    592
  • 22/03/2019

    Новосибирские биологи совместно с иностранными коллегами изучили общего предка коровы и кита

    ​Ученые из Англии, США, Китая и России определили все основные перестройки хромосом и геномов китопарнокопытных во всех круциальных (подверженных эволюционной трансформации участках хромосом) точках их эволюции.
    400
  • 14/06/2018

    В СО РАН продолжается обсуждение проектов развития исследовательской инфраструктуры ННЦ

    ​Проект Сибирского национального центра высокопроизводительных вычислений, обработки и хранения данных (СНЦ ВВОД) представил заместитель председателя СО РАН академик Павел Владимирович Логачёв. «В современных исследованиях во всех областях знаний научные данные являются ключевым драйвером, — подчеркнул координатор проекта.
    973
  • 05/12/2016

    Сибирские генетики и управление фотосинтезом

    ​Ученые Новосибирского государственного университета и Института цитологии и генетики СО РАН отвечают на вопрос о том, как на генетическом уровне регулируется синтез и распределение хлорофилла в разных органах растений, исследуя геномы обычного ячменя и ячменя частичного альбиноса, у которого нарушена выработка хлорофилла.
    2285
  • 19/06/2018

    Новосибирские ученые исследовали, как «врезаются» друг в друга молекулы на рельсах ДНК

    ​Ученые из САЕ «Синтетическая биология» НГУ провели исследование поведения ДНК-полимераз при столкновении с так называемыми «пришитыми» к ДНК белками. Полученные результаты дают основание для разработки искусственных ДНК-полимераз, которые можно использовать для различных целей.
    593
  • 28/08/2017

    После Дарвина и Энгельса: формула Колесникова

    ​Научная биография Чарльза Дарвина начиналась негромко. Вернувшись в 1836 году из кругосветного плаванья, он с 1838 года работал секретарем Лондонского геологического общества. И только в 1859-м опубликовал работу «Происхождение видов путём естественного отбора, или Сохранение благоприятствуемых пород в борьбе за жизнь», ставшую основой теории эволюции и самого понятия «дарвинизм».
    1001