Ученые Курчатовского геномного центра ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН» займутся секвенированием пангеномов сельскохозяйственных сортов картофеля, пшеницы и ячменя и разработкой технологии компьютерного фенотипирования растений. 
 
«В прошлом году ФИЦ ИЦиГ СО РАН в составе консорциума “Курчатовский геномный центр” стал победителем конкурса на создание геномных центров мирового уровня в рамках национального проекта “Наука”. Уже полгода, как идет работа в этом направлении, и получены первые результаты», — говорит министр науки и инновационной политики Новосибирской области кандидат физико-математических наук Алексей Владимирович Васильев.
 
«Здесь решается целый комплекс задач. В первую очередь это фундаментальная наука, исследование геномов сортов растений и пород животных, характерных для РФ, и создание на их основе новых сортов и технологий, которые будут внедряться в сельское хозяйство нашей страны. Также мы занимаемся разработкой и применением новых технологий в области маркерной и геномной селекции, геномного редактирования. Другая часть наших задач связана с биотехнологиями на основе микроорганизмов для кормопроизводства и промышленности», — отмечает директор ФИЦ ИЦиГ СО РАН член-корреспондент РАН Алексей Владимирович Кочетов
 
Одно из основных направлений Центра — модификация зерновых с помощью различных подходов (маркерная селекция, геномное редактирование) для получения более продуктивных, высококачественных, устойчивых к заболеваниям сортов с высокой вегетацией, подходящей для нашего климата. «Начаты работы по созданию линий пшеницы с различным содержанием цинка и железа в зерне, голозерных сортов ячменя. Также в рамках Геномного центра разрабатываются новые сорта овощных культур, в частности картофеля», — рассказывает руководитель отделения Курчатовского геномного центра ФИЦ ИЦиГ СО РАН доктор биологических наук Елена Артёмовна Салина.
 
DSC_9079.jpg 
   Пшеница в ИЦиГ СО РАН
 
Для генетики и селекции новых признаков сегодня необходимы обширные знания о геномах растений. «В рамках нашего проекта запланировано секвенирование так называемых пангеномов, которое предполагает прочтение генома не одного сорта растений, а нескольких его ближайших родственников, популяций из разных генотипов, сортов, линий. Это делается для того, чтобы мы могли на основе сравнения геномных последовательностей популяций оценить вариабельность генома, определить, какие мутации присутствуют и как они ассоциированы с различными важными признаками», — говорит ведущий научный сотрудник Курчатовского геномного центра ФИЦ ИЦиГ СО РАН кандидат биологических наук Дмитрий Аркадьевич Афонников. В рамках этого проекта ученые планируют собрать большой массив данных, связанных с накоплением последовательностей геномов пшеницы, ячменя и картофеля. Исследователи будут секвенировать, сравнивать между собой десятки тысяч растений и на основе полученной информации оценивать происхождение линий и сортов, определять полезные и вредные мутации.
 
Другое направление, которым займется центр — фенотипирование высокопроизводительных растений. «Селекция начинается с того, что мы должны выделить важный признак, связанный с урожайностью, продуктивностью, измерить и оценить его вариабельность в популяции. Ранее эта работа была очень трудоемкой. Всё делалось вручную с помощью линеек, на глаз. В рамках нашего проекта мы будем разрабатывать компьютерные технологии, которые позволят повысить эффективность этого фенотипирования в сотни и тысячи раз», — объясняет Дмитрий Афонников. 
 
В этом случае исследователю для того, чтобы измерить, например, параметры колоса, не придется ходить по полю с линейкой (а ведь нужно обрабатывать тысячи образцов). Достаточно будет сфотографировать на смартфон, а затем уже программа автоматически произведет все необходимые измерения. Кроме того, компьютерные методы фенотипирования исключают субъективизм: проводить измерения с помощью такой технологии с одинаковой точностью сможет и студент, и кандидат наук. Ученые утверждают, что такие технологии могут быть использованы для широкого круга исследований. 
 
Другая часть комплекса задач Курчатовского геномного центра — образовательная. Так, уже сейчас при его содействии в Новосибирском государственном университете формируется структура «Институт генетических технологий НГУ», где будет происходить подготовка специалистов в области генетики. Налажены контакты с Новосибирским государственным аграрным университетом и с рядом других вузов. Сформирована программа для заявки на конкурс по созданию научно-образовательных центров мирового уровня, ориентированных на взаимодействие с реальным сектором экономики. «Технологии, которые сейчас нарабатываются, конечно, составят основу индустриальных проектов, которые будут реализоваться в рамках национального проекта “Наука”», — отмечает Алексей Васильев.
 
«Наука в Сибири»
 
Фото Юлии Поздняковой



Источники

Ученые Новосибирского научного центра присоединились к работе над созданием лекарства от коронавируса
49 канал, 26/05/2020
Ученые Новосибирского научного центра присоединились к работе над созданием лекарства от коронавируса
НСК 49 (tv49.ru), 26/05/2020
В Новосибирске развиваются геномные исследования сельскохозяйственных растений
Сибирское отделение Российской академии наук (sbras.ru), 27/05/2020
В Новосибирске развиваются геномные исследования сельскохозяйственных растений
Наука в Сибири (sbras.info), 26/05/2020
В Новосибирске развиваются геномные исследования сельскохозяйственных растений
Infopro54.ru, 26/05/2020
В Новосибирске развиваются геномные исследования сельскохозяйственных растений
Russia24.pro, 26/05/2020
В НОВОСИБИРСКЕ РАЗВИВАЮТСЯ ГЕНОМНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ РАСТЕНИЙ
Биотех 2030 (biotech2030.ru), 27/05/2020
Селекция Hi-tech
Академгородок (academcity.org), 27/05/2020
Селекция Hi-tech
Seldon.News (news.myseldon.com), 27/05/2020
Точнее в тысячу раз: приложение позволит ученым рассчитать урожайность по фото
Сибкрай.ru (sibkray.ru), 27/05/2020
В Новосибирске развиваются геномные исследования сельскохозяйственных растений
Агро XXI (agroxxi.ru), 29/05/2020
В Новосибирске развиваются геномные исследования сельскохозяйственных растений
Рамблер/новости (news.rambler.ru), 29/05/2020
В Новосибирске развиваются геномные исследования сельскохозяйственных растений
Seldon.News (news.myseldon.com), 29/05/2020
В Новосибирске развиваются геномные исследования сельскохозяйственных растений
Uprava.org, 29/05/2020
В Новосибирске развиваются геномные исследования сельскохозяйственных растений
Novosibirsk.4geo.ru, 29/05/2020
Селекционеры приступили к созданию лечебной пшеницы - AgroExpert -...
Agroexpert (agroexpert.md), 02/06/2020
Селекция Hi-tech
Картофельный Союз (welikepotato.ru), 29/05/2020
Новосибирские ученые приступили к созданию лечебной пшеницы (Видео)
Exp.idk.ru, 28/05/2020
Новосибирские ученые приступили к созданию лечебной пшеницы (Видео)
Seldon.News (news.myseldon.com), 28/05/2020
Пшеница, которая лечит
СТС-Мир, 27/05/2020
В Новосибирске развиваются геномные исследования сельскохозяйственных растений
Босс Агро (bossagro.kz), 03/06/2020

Похожие новости

  • 02/06/2020

    Найти лекарство от коронавируса и облегчить работу селекционерам: над чем сейчас работает Институт цитологии и генетики СО РАН

    ​Пригодилось для другого Когда мы начинаем узнавать новости о какой-то новой вирусной болезни, первым делом надеемся на то, что Академгородок и его учёные обязательно помогут — найдут лекарство от чего угодно.
    872
  • 29/01/2021

    Учащиеся СУНЦ НГУ реализуют собственные исследовательские проекты в лабораториях ИЦиГ СО РАН

    В лабораториях ИЦиГ СО РАН работают учащиеся, которые посещают спецкурсы Лаборатории инженерного конструирования СУНЦ НГУ и выбрали там направление «Биоинформатика». Проекты по биоинформатике выполняются под руководством научных сотрудников института.
    815
  • 29/09/2020

    В Новосибирской области реализуется проект по созданию АгроНОЦ

    Регион подготовил около 50 различных проектов, направленных на решение актуальных задач в области сельского хозяйства и животноводства, в рамках которых планируется наладить взаимодействие аграрной науки, бизнеса и агропромышленного комплекса.
    813
  • 29/05/2020

    Наука мирового уровня: пресс-тур в ФИЦ ИЦиГ СО РАН

    ​​Выведение трансгенных мышей для тестирования  вакцин при COVID-19, разработка технологий и препаратов для лечения коронавируса, использование генетики для создания новых сортов сельхозкультур и другие актуальные научные исследования реализуют учёные Института цитологии и генетики СО РАН.
    978
  • 16/02/2021

    Новосибирские учёные исследуют поражающий пшеницу грибок

    В Институте цитологии и генетики СО РАН школьник вместе с учёными проводит опыты с опасным грибком, поражающим урожай пшеницы. Сибирские исследователи хотят доказать, что изучив гены, злаки можно спасти.
    482
  • 30/12/2020

    Топ-30 разработок сибирских ученых в 2020 году

    ​На портале «Новости сибирской науки» можно познакомиться с инновациями и последними достижениями сибирских ученых. Сегодня мы предлагаем вашему вниманию Топ-30 сообщений о наиболее значимых и интересных научных разработках 2020 года, размещенных на нашем сайте.
    6147
  • 02/12/2020

    ИЦиГ СО РАН заключил соглашение о сотрудничестве с ЭФКО и НГУ

    ​​1 декабря 2020 года было подписано трехстороннее соглашение о сотрудничестве между Институтом цитологии и генетики СО РАН, Новосибирским государственным университетом и компанией «ЭФКО» (крупнейший российский производитель спецжиров и маргарина, также выпускает майонез, растительные масла, кетчупы, молочные и кисломолочные продукты).
    943
  • 11/11/2020

    АгроНОЦ против барьеров, мешающих эффективному агробизнесу

    В Новосибирской области РФ подготовлено около 50 различных проектов, направленных на решение актуальных задач в области сельского хозяйства и животноводства, в рамках которых планируется наладить взаимодействие аграрной науки, бизнеса и агропромышленного комплекса.
    741
  • 28/06/2019

    Чудо-пшеницу создают генетики для борьбы с мировым голодом

    ​ Как прокормить всю планету — обсудили 25 июня генетики из разных стран. Считается, что для этого через 30 лет человеку придётся производить на 70% больше продуктов, чем сейчас.
    879
  • 22/03/2021

    Ускоренный отбор. Генетические технологии обеспечивают продовольственную безопасность

    ​ В свое время создание сорта яровой пшеницы «Новосибирская-67» окупило первую очередь строительства Новосибирского Академгородка, как отмечал отец-основатель Сибирского отделения АН СССР академик Михаил Лаврентьев.
    735