​Диагноз «рак легких» зачастую ставится на последних стадиях, из-за чего смертность от заболевания по всему миру составляет примерно 80 %. Поэтому ученые озабочены поиском маркеров, способных выявить болезнь на начальном этапе.

Так, в качестве индикатора сибирские исследователи решили использовать содержащиеся в крови микроРНК — статья об этом была опубликована в журнале Scientific Reports.

Современные методы для выявления рака легких неидеальны. Сейчас тип заболевания определяется на основе гистологических срезов, но опухоли часто гетерогенны по клеточному составу, и клетки новооборазования могут обладать разным генотипом. Как следствие, на срезе оказывается одна популяция клеток, однако наиболее злокачественные нередко находятся на другой части опухоли и нуждаются в ином лечении.

"На данный момент в онкодиагностике развивается так называемая жидкостная биопсия - исследование в крови онкомаркеров: фрагментов ДНК, мутаций, генетических меток, а также изменений количества таких последовательностей. Мы же использовали в качестве индикаторов микроРНК - малые некодирующие молекулы РНК. Они могут как способствовать, так и препятствовать развитию опухоли, а их трансформации при этом транслируются в кровь. Кроме того, мРНК обладают высокой стабильностью и не деградируют под действием ферментативных систем крови - то есть не так быстро поглощаются или фильтруются ее клетками", - рассказывает младший научный сотрудник Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Иван Андреевич Запорожченко.

С другой стороны, при использовании подобного маркера существует несколько очевидных проблем. В частности, некоторые диагнозы можно поставить по наличию одной конкретной (свойственной этому заболеванию) мутации. В случае с мРНК о заболевании можно говорить только исходя из изменения их количества в крови, а потому нужно понимать, какая численность является индикатором тревожного состояния. Для понимания таких рамок необходимо делать панель различных маркеров, которая суммарно даст диагностическую информацию.

"Мы попытались посмотреть на известные (на основе исследований других ученых) маркеры. Всего было отобрано 179 различных мРНК: они более представлены в организме, а потому их проще детектировать. Отмечу, что многие микроРНК активно экспрессированы в клетках крови, соответственно при разрушении клеток, особенно частом у онкологических больных (в том числе, из-за приема лекарств), они тоже разрушаются. Так что в первую очередь нами рассматривались маркеры, которые не должны быть чувствительны к таким эффектам", - добавляет Иван Запорожченко.

Изначально ученые взяли кровь у 20 больных и 10 здоровых людей: в результате были обнаружены существенные изменения ряда мРНК между двумя группами. Однако специалисты посчитали, что для диагностической системы нужен более глубокий анализ. Поэтому в следующий раз они добавили еще одну группу людей - с диагнозом эндобронхит: подобное состояние сопутствует многим заболеваниям и предполагает нарушение структуры или разрастание ткани легких.

"Это своего рода контроль того, что маркер окажется специфичен не только к изменению структуры легкого, а именно к злокачественным преобразованиям. Условно, здоровые люди находятся на одном конце спектра, онкологические больные - на другом, а между ними остается множество пограничных состояний. Мы попытались закрыть этот пробел, чтобы найти более точный индикатор злокачественности процесса", - поясняет ученый.

После специалисты перенесли полученные данные в цифровой формат и проанализировали. Для этого они объединили сведения о конкретных мРНК, трансформировавшихся в крови у каждого пациента: в результате все мРНК, по сути, оказались усреднены. Затем ученые использовали метод LASSO - пенализованной логистической регрессии. Задача обычной регрессии - выявить тренд в существующей информации: в этом случае учитываются все данные, и некоторые из них, по значениям далекие от основных результатов (выбросы), нередко существенно влияют на результат. LASSO же фильтрует данные: захватывает наиболее распространенные показатели, таким образом составляя наименьшую выборку.

В итоге сибирские специалисты отобрали 14 маркеров. Также были обнаружены пересечения с более масштабными результатами группы итальянских ученых, а значит, можно говорить о воспроизводимости исследования. Помимо выявления заболеваний, такие мРНК могли бы помочь спрогнозировать динамику или выявить изменения в течении рака легких, что нельзя сделать современными клиническими способами. Полученные данные статистически достоверны, но выборка пока не велика, поэтому ученые планируют перейти к сбору более масштабных сведений и продолжить наблюдать за выявленными показателями.

Алена Литвиненко

Источники

Сибирские ученые улучшают диагностику рака легких
Наука в Сибири (sbras.info), 15/08/2018
Новосибирские ученые предложили новый способ ранней диагностики рака легких
Новосибирский городской сайт (ngs.ru), 15/08/2018
Новосибирские ученые нашли способ улучшить точность диагностики рака легких
ТАСС, 15/08/2018
Новосибирские ученые нашли способ улучшить точность диагностики рака легких
TmBW.Ru, 15/08/2018
Новосибирские ученые нашли способ улучшить точность диагностики рака легких
Спутник Новости (news.sputnik.ru), 15/08/2018
"Новосибирские ученые предложили новый способ ранней диагностики рака легких"
Ivest.kz, 15/08/2018
Ученые СО РАН разрабатывают новый способ диагностики рака
БезФормата.Ru Новосибирск (novosibirsk.bezformata.ru), 15/08/2018
Ученые СО РАН разрабатывают новый способ диагностики рака
Сибкрай.ru (sibkray.ru), 15/08/2018
Новый способ диагностики рака легких разрабатывают новосибирские ученые
Newirkutsk.ru, 15/08/2018
Сибирские ученые нашли способ выявления рака легких на ранних этапах
Российская газета (rg.ru), 15/08/2018
Сибирские ученые придумали, как лучше диагностировать рак легких
ВашГород.ру (vashgorod.ru), 15/08/2018
Новосибирские ученые предложили новый способ ранней диагностики рака легких
Монависта (novosibirsk.monavista.ru), 15/08/2018
Сибирские ученые нашли способ выявления рака легких на ранних этапах
Новости регионов России (skoronovosti.ru), 15/08/2018
Выявлять рак легких по крови научились ученые Новосибирска
Все новости Новосибирской области (vn.ru), 15/08/2018
Ученые разработали новый способ выявления рака легких
Новости регионов России (skoronovosti.ru), 15/08/2018
Новосибирские ученые разрабатывают новый способ диагностики рака
RuNews24 (runews24.ru), 15/08/2018
Новосибирские ученые предложили новый способ ранней диагностики рака легких
БезФормата.Ru Новосибирск (novosibirsk.bezformata.ru), 15/08/2018
Новосибирские ученые СО РАН разрабатывают новый способ диагностики рака‍
Любимый город (1nsk.ru), 15/08/2018
Создан новый метод диагностики рака легких на самых ранних стадиях развития
Mogu.by, 16/08/2018
Создан новый метод диагностики рака легких на самых ранних стадиях развития
MEDdaily (meddaily.ru), 16/08/2018
Создан новый метод диагностики рака легких на самых ранних стадиях развития
Newsmir.info, 16/08/2018
Создан новый метод диагностики рака легких на самых ранних стадиях развития
Новости дня России и мира (novostidnya24.ru), 16/08/2018
Создан новый метод диагностики рака легких на самых ранних стадиях развития
Muzobzor.ru, 17/08/2018
Светлана Смирнихина: редактировать геном в России начнут через четыре года
РИА Новости, 17/08/2018
Создан новый метод диагностики рака легких на самых ранних стадиях развития
Здоровая Чувашия (med.cap.ru), 17/08/2018
Создан новый метод диагностики рака легких на самых ранних стадиях развития
Recipe.ru, 17/08/2018
Создан новый метод диагностики рака легких на самых ранних стадиях развития
Dropnews.ru, 17/08/2018
Создан новый метод диагностики рака легких на самых ранних стадиях развития
MedBlog (medblog.su), 17/08/2018
Новосибирские ученые нашли способ обнаружения рака груди на ранних стадиях
Newsmir.info, 17/08/2018
Новосибирские ученые нашли способ обнаружения рака груди на ранних стадиях
Дело (delo-kira.ru), 17/08/2018
Новосибирские ученые нашли способ обнаружения рака груди на ранних стадиях
Vistanews.ru, 17/08/2018
Новосибирские ученые нашли способ обнаружения рака груди на ранних стадиях
Монависта (monavista.ru), 17/08/2018
Ученые из Новосибирска нашли способ более точно диагностировать рак легких
БК55 (bk55.ru), 19/08/2018
В Новосибирске ученые предложили новый тип диагностики рака
Medotvet.com, 19/08/2018
Началось общественное обсуждение стратегии цифровой трансформации Новосибирской области
Business_news.complexdoc.ru, 18/08/2018
В ИХБФМ СО РАН обнаружили маркер, способный выявить опухоль в легких на ранних стадиях
1k.com.ua, 11/09/2018
В ИХБФМ СО РАН обнаружили маркер, способный выявить опухоль в легких на ранних стадиях
Научная Россия (scientificrussia.ru), 11/09/2018

Похожие новости

  • 12/08/2016

    Новосибирский ученый разработал новый метод генерации биспецифичных терапевтических антител

    ​Аспирант Новосибирского государственного университета Виктор Принц разработал новый метод генерации биспецифичных терапевтических иммуноглобулинов на основе процесса, который происходит в организме человека.
    1480
  • 09/11/2017

    Научная молодежь: разработки, амбиции, планы

    ​В ТАСС (Новосибирск) накануне Всемирного дня науки состоится круглый стол, посвященный открытиям молодых ученых, их участию в крупных научных проектах. Молодые представители СО РАН - Института горного дела, Института химической биологии и фундаментальной медицины, Института цитологии и генетики, а также действующие и новые резиденты Академпарка, расскажут о ряде проектов, над которыми ведется работа в этом году.
    932
  • 23/08/2017

    Коктейли из бактериофагов как замена антибиотиков

    ​В Институте химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН разрабатываются терапевтические препараты бактериофагов нового поколения, которые представляют собой мягкую и безопасную альтернативу антибиотикам.
    993
  • 20/06/2018

    Возможные перспективы Академгородка 2.0

    ​Ведущие ученые СО РАН продолжили обсуждение проектов развития научной инфраструктуры Новосибирского научного центра. Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова СО РАН выступил инициатором проекта «Сибирский центр малотоннажной химии».
    324
  • 19/04/2017

    Ученые установили, что управляет термогенезом

    ​Ранее считалось, что в термогенезе - процессе выработки тепла - ключевую роль играют макрофаги, один из видов белых клеток крови. Однако ученые из Школы медицины Икан на горе Синай (Icahn School of Medicine at Mount Sinai) в США во главе с профессором медицины Кристофом Бюттнером (Christoph Buettner) доказали, что за термогенез отвечает мозг.
    857
  • 05/09/2017

    ТОП-5 материалов августа на портале SIBMEDA

    Редакция SIBMEDA публикует рейтинг популярных, по мнению читателей, новостей и статей, размещенных на портале в августе.   1. Роспотребнадзор изымает из обращения два популярных анестетика из-за развития нежелательных реакций Роспотребнадзор сообщает о решении приостановить реализацию лекарственных препаратов «Лидокаин, раствор для инъекций 100 мг/мл 2 мл» и «Новокаин, раствор для инъекций 5 мг/мл 10 мл» в связи с развитием нежелательной реакции.
    515
  • 25/07/2018

    В ИХБФМ СО РАН полезные белки научат самостоятельно бороться с раковыми опухолями

    ​Научить полезные белки самостоятельно бороться с раковыми опухолями - цель специалистов Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН. В разные эпохи люди больше всего боялись разных болезней.
    188
  • 05/07/2017

    В новосибирском Академгородке прошла конференция по высокопроизводительному секвенированию в геномике

    ​​Ученые из Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН представили новые методы, использующие NGS секвенирование, уникальные для нашей страны, на II Всероссийской конференции "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", прошедшей в новосибирском Академгородке.
    1083
  • 06/12/2017

    АлтГУ разрабатывает инновационные лекарственные препараты в рамках стратегического проекта

    ​Алтайский государственный университет активно реализует стратегический проект по внедрению инновационных методов получения и использования лекарственного сырья природного происхождения и лекарственных средств на его основе.
    725
  • 22/11/2017

    Юбилей академика Валентина Викторовича Власова

    Валентин Викторович Власов родился 22 ноября 1947 года в г. Новосибирске. В 1969 году окончил Факультет естественных наук (химическое отделение) Новосибирского государственного университета. Далее — в НИОХ СО АН СССР: аспирантура, младший, старший научный сотрудник, заведующий лабораторией нуклеиновых кислот, заместитель директора Института.
    898