Внутривидовая классификация культурных растений необходима для эффективного сохранения биологического разнообразия видов, изучения их происхождения, определения филогении и проведения межвидовой гибридизации при селекции. Современные возделываемые виды пшениц произошли от трех диких диплоидных предков в результате гибридизации и нескольких раундов удвоения геномов и представлены ди-, тетра- и гексаплоидными видами. Поэтому идентификация плоидности пшениц и определение их геномного состава являются одними из основных этапов их классификации на основе визуального анализа фенотипических признаков колоса. 

Команда проекта 7.1 в рамках Первого воркшопа математического центра в Академгородке опубликовала работу, описывающую результаты того, как в режиме погружения команда проверяла гипотезу о возможности определения плоидности пшеницы при помощи методов компьютерного зрения, только лишь на основании изображения колоса.

— Нам удалось показать, что полученные при помощи компьютерного анализа изображений морфологические характеристики колосьев для гекса- и тетрапроидных видов могут быть использованы при разработке методики классификации растений по плоидности и их видовой принадлежности в автоматическом режиме, — рассказывает о полученных результатах Михаил Генаев, куратор проекта «Анализ колоса пшеницы методами компьютерного зрения. Определение плоидности», старший научный сотрудник лаборатории эволюционной биоинформатики и теоретической генетики Курчатовского геномного центра ИЦиГ СО РАН. — Работа в рамках воркшопа — удачный пример того, как силами коллектива из пяти студентов и двух кураторов в течение нескольких недель можно решить актуальную биологическую задачу и получить новые научные результаты, — резюмирует Михаил в своей статье на Habr.

— Работа над проектом в рамках воркшопа дала возможность не только погрузиться в процесс решения прикладной задачи в новой для меня области, но и развить умения работать в команде и представлять промежуточные результаты. Интересная задача, грамотно поставленная кураторами проекта, и интенсивный формат работы, подготовленный организаторами воркшопа, позволили нашей группе существенно продвинуться в решении за сравнительно небольшой промежуток времени, — отмечает инженер Математического центра в Академгородке, магистрант Механико-математического факультета  НГУ Никита Прохошин.

Статья «Автоматическое фенотипирование морфологии колоса тетра- и гексаплоидных видом пшеницы методами компьютерного зрения» — одна из первых вышедших работ, описывающих результаты, которые получили проектные команды в рамках Первого воркшопа МЦА.

— Проведенное исследование и его результат в виде публикации в серьезном журнале свидетельствуют о том, что реализуемый Математическим центром в Академгородке новый принцип организации исследовательской и образовательной деятельности действительно обеспечивает быстроту входа в междисциплинарную область и получение значимых результатов. Я очень рад, что эту деятельность мы реализуем вместе с ведущими партнерами, среди которых Курчатовский геномный центр ИЦиГ СО РАН. В перспективе подобное сотрудничество может существенно изменить систему разделения труда РФ, — комментирует декан Механико-математического факультета, ведущий ученый Математического центра в Академгородке Игорь Марчук.

— Я надеюсь, что в рамках Большой математической мастерской — масштабного приемника Первого воркшопа МЦА — все больше молодых исследователей сможет погрузиться в интересные проекты и получить серьезные, в том числе продуктовые, результаты.

Похожие новости

  • 19/09/2019

    Союз биологии и математики

    ​​Биоинформатика – одно из самых динамично развивающихся направлений современной науки. И новосибирский Академгородок принимает в этом процессе самое активное участие. Именно здесь, еще в прошлом веке сформировалась одна из ведущих мировых школ математической биологии, из которой впоследствии и «выросла» биоинформатика.
    852
  • 22/03/2021

    Ускоренный отбор. Генетические технологии обеспечивают продовольственную безопасность

    ​ В свое время создание сорта яровой пшеницы «Новосибирская-67» окупило первую очередь строительства Новосибирского Академгородка, как отмечал отец-основатель Сибирского отделения АН СССР академик Михаил Лаврентьев.
    631
  • 29/06/2020

    Михаил Федорук: «Мы должны сделать Академгородок лучшим местом для жизни»

    Интервью с ректором Новосибирского государственного университета академиком Михаилом Петровичем Федоруком о том, почему программа «Академгородок 2.0» должна быть комплексным решением, что такое университет мирового класса и какова роль НГУ в нацпроекте «Наука».
    1379
  • 02/12/2020

    ИЦиГ СО РАН заключил соглашение о сотрудничестве с ЭФКО и НГУ

    ​​1 декабря 2020 года было подписано трехстороннее соглашение о сотрудничестве между Институтом цитологии и генетики СО РАН, Новосибирским государственным университетом и компанией «ЭФКО» (крупнейший российский производитель спецжиров и маргарина, также выпускает майонез, растительные масла, кетчупы, молочные и кисломолочные продукты).
    893
  • 05/02/2021

    Губернатор Новосибирской области поздравил всех со стартом Года науки и технологий

    Губернатор Андрей Травников принял участие в работе коллегии министерства науки и инновационной политики Новосибирской области.  Глава региона поздравил собравшихся с наступающим Днем российской науки, начавшимся Годом науки и технологий, пожелал участникам коллегии успехов, новых достижений и поводов для гордости за новосибирских исследователей.
    1028
  • 29/04/2021

    Новая магистерская программа по генетике и селекции

     ​​Институт цитологии и генетики СО РАН совместно с Новосибирским государственным аграрным университетом запустили новую магистерскую программу по генетике и селекции. ​Видео  
    748
  • 22/07/2020

    «Идея интеграции дает результат»

    ​Министр науки и высшего образования Российской Федерации Валерий Николаевич Фальков и губернатор Новосибирской области Андрей Александрович Травников рассказали о том, как реализуется проект Центра коллективного пользования «Сибирский кольцевой источник фотонов», программа «Академгородок 2.
    1361
  • 03/06/2020

    Ученые вывели пшеницу, которая защищает человека от вирусов

    Омские селекционеры вывели новые сорта цветной пшеницы, которые помогут повысить иммунитет, защитив от болезней и вирусов. И сумели окультурить пырей до уровня многолетней пшеницы. Посеял один раз - и семь лет собирай урожай.
    917
  • 11/11/2020

    АгроНОЦ против барьеров, мешающих эффективному агробизнесу

    В Новосибирской области РФ подготовлено около 50 различных проектов, направленных на решение актуальных задач в области сельского хозяйства и животноводства, в рамках которых планируется наладить взаимодействие аграрной науки, бизнеса и агропромышленного комплекса.
    597
  • 02/09/2019

    Инфраструктура лидерства

    ​Новосибирская область уверенно закрепилась в двадцатке Национального рейтинга состояния инвестиционного климата и реализует амбиции мирового инновационного центра. По итогам 2018 года регион достиг наилучших показателей в своей истории по объему инвестиций в основной капитал - 196 млрд рублей.
    866