Ученые из Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН разработали комбинированный метод детекции РНК гриппа H1N1 и SARS-CoV-2. Он значительно быстрее, чем ПЦР, проводится при невысокой температуре и не требует дорогостоящего сложного оборудования.

Сегодня известно множество заболеваний, вызванных вирусными инфекциями. Более 90 % из них вызваны РНК-содержащими вирусами. Самые известные представители — грипп А, вызывающий сезонную заболеваемость в России и в мире, и коронавирус Sars-CoV-2, вызвавший пандемию Covid-19 в 2020 году.

Если вирус своевременно не выявить и не принять меры, заболевания могут привести к осложнениям в разных системах органов и даже к смерти. В связи с этим возникает необходимость в применении как можно более быстрых диагностических методов еще во время инкубационного периода, чтобы предотвратить передачу заболевания и вовремя начать лечение. 

Один из методов выявления — полимеразная цепная реакция (ПЦР). Его модификация, ПЦР в режиме реального времени, которая используется сейчас повсеместно, не позволяет получить результат менее, чем за 1,5—3 часа диагностики и предполагает использование дорогостоящего оборудования. В то же время методы изотермической амплификации не требуют сложных установок и позволяют провести анализ при 37  °С за час с учетом пробоподготовки. 

Одним из видов изотермической амплификации является NASBA (Nucleic Acid Sequence-Based Amplification). Он позволяет многократно увеличивать концентрацию разнообразных молекул РНК и эффективен для подтверждения (или исключения) наличия возбудителя в спорных случаях, когда возбудителя в биологической жидкости настолько мало, что ПЦР не может его обнаружить. NASBA может быть использована для обнаружения возбудителя инфекции в тех случаях, когда воспалительный процесс протекает бессимптомно или латентно.

Сотрудники лаборатории геномного редактирования ИХБФМ СО РАН разработали комбинацию NASBA и Cas13a-опосредованной интерференции. Белок Cas13a специализируется на специфическом узнавании и расщеплении определенных фрагментов РНК. Достоверность метода была подтверждена на фрагментах РНК вируса гриппа А и коронавируса. «Детекция состоит из двух этапов: первый — изотермическая амплификация NASBA — позволяет получить огромную концентрацию фрагмента РНК вируса, а второй — подтвердить, что это именно тот самый фрагмент, расщепить его и получить детектируемый сигнал. При этом детектируемый сигнал возникает за счет неспецифической активности белка, запускаемой после расщепления целевого фрагмента. В реакции есть специально подобранная сторонняя РНК, меченная органическим соединением — флюорофором. При ее расщеплении и возникает тот самый специфический сигнал (свечение) пробирки, содержащей вирусную РНК», — рассказывает младший научный сотрудник лаборатории геномного редактирования ИХБФМ СО РАН Денис Николаевич Антропов.

Улучшенный метод имеет преимущества перед ПЦР. «Требуется меньше времени на реакцию, не нужна сложная специализированная техника, создающая температурные циклы, — все процессы протекают при одной и той же температуре. Это качественный способ выявить вирус», — добавляет Денис Антропов.

Доклад на тему «Разработка методов детекции РНК гриппа А и коронавируса» был представлен на секции «Вирусология» научной конференции форума OpenBio.

«Наука в Сибири»

Источники

Сибирские ученые придумали быстрый способ выявления гриппа А и коронавируса
Наука в Сибири (sbras.info), 27/10/2020
Ученые СО РАН придумали быстрый способ выявления коронавируса
News-Life (news-life.pro), 27/10/2020
Ученые СО РАН придумали быстрый способ выявления коронавируса
RU24.pro, 27/10/2020
Сибирские ученые придумали быстрый способ выявления коронавируса
Тайга.инфо (tayga.info), 27/10/2020
Ученые из Академгородка разработали быстрый способ выявления гриппа и COVID-19
Академия новостей (academ.info), 27/10/2020
Ученые создали комбинированную тест-систему для коронавируса и гриппа
Inline.ru, 27/10/2020
В Новосибирске разработали быстрый способ выявления гриппа и COVID-19
The world news (theworldnews.net), 27/10/2020
Ученые создали комбинированную тест-систему для коронавируса и гриппа
Стопкоронавирус.рф, 27/10/2020
Новосибирские ученые разработали быстрый способ выявления гриппа и COVID-19
Российская газета. СФО (rg.ru), 27/10/2020
Ученые создали комбинированную тест-систему для коронавируса и гриппа
Дело (delo-kira.ru), 27/10/2020
Новосибирские ученые придумали быстрый способ выявления гриппа А и коронавируса
РИА Сибирь (ria-sibir.ru), 27/10/2020
Новосибирские ученые разработали комбинированную тест-систему для коронавируса и гриппа
Seldon.News (news.myseldon.com), 27/10/2020
Ученые СО РАН придумали быстрый способ выявления коронавируса
Ndn.info, 27/10/2020
Сибирские ученые придумали быстрый способ выявления коронавируса
Устав (ustav.top), 27/10/2020
Сибирские ученые нашли простой и быстрый способ выявления COVID-19
ГТРК Новосибирск, 27/10/2020
Быстрый и дешевый тест на ковид придумывают новосибирские ученые
Официальный сайт г. Новосибирск (nsknews.info), 27/10/2020
Ученые создали комбинированную тест-систему для коронавируса и гриппа
Коронавирус (coronavirusstat.ru), 27/10/2020
Новосибирские ученые придумали быстрый тест на коронавирус
Московский Комсомолец # Новосибирск (novos.mk.ru), 27/10/2020
Новосибирские ученые разработали быстрый способ выявления коронавируса
Om1.ru, 28/10/2020
Новосибирские ученые разработали быстрый способ выявления COVID-19 и гриппа
Аргументы и Факты (nsk.aif.ru), 28/10/2020
Новосибирские ученые создали комбинированный тест на коронавирус и грипп
Сиб.фм (sib.fm), 28/10/2020
Новосибирские ученые создали комбинированный тест на коронавирус и грипп
Gorodskoyportal.ru/novosibirsk, 28/10/2020
Новосибирский производитель компонентов тест-систем на коронавирус удвоил производство
Пульс Хакасии (pulse19.ru), 28/10/2020
Ученые Новосибирска предложили новый метод тестирования на COVID-19
Russia24.pro, 28/10/2020
Новосибирские ученые придумали быстрый тест на коронавирус и грипп
Сибкрай.ru (sibkray.ru), 28/10/2020
Ученые разработали тест-систему для выявления коронавируса и вируса гриппа всего за один час. 28.10.2020 15:43
Мой Благовещенск (blagoveshensk.ru), 28/10/2020
Сибирские ученые нашли простой и быстрый способ выявления COVID-19
Новосибирская областная ассоциация врачей (noav.ru), 28/10/2020
Новосибирские ученые нашли новый метод определения коронавируса и гриппа
РБК (nsk.rbc.ru), 28/10/2020
В Академгородке придумали комбинированную тест-систему для коронавируса и гриппа
Новая Сибирь (newsib.net), 28/10/2020
Сибирские ученые придумали быстрый способ выявления гриппа А и коронавируса
Поиск (poisknews.ru), 29/10/2020
В ИХБФМ СО РАН разработали способ быстрого выявления гриппа А и коронавируса
Научная Россия (scientificrussia.ru), 02/11/2020
Светится и меняет цвет: ученые нашли способ быстро определить ковид
Сибкрай.ru (sibkray.ru), 12/11/2020

Похожие новости

  • 28/10/2020

    Новосибирские биологи модифицируют химерное антитело от клещевого энцефалита

    ​Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины (ИХБФМ) СО РАН планируют модифицировать химерное антитело, на основе которого создается препарат от клещевого энцефалита, для его связи с различными субтипами вируса, сообщил журналистам в ходе площадки открытых коммуникаций OpenBio научный сотрудник ИХБФМ СО РАН Иван Байков.
    323
  • 18/12/2018

    Сибирские биохимики нашли связь дефектов стволовых клеток с аутоиммунными заболеваниями

    ​Рассеянный склероз, волчанка и другие аутоиммунные болезни могут возникать из-за серьезных нарушений в работе стволовых клеток костного мозга, заставляющих их собирать особые агрессивные антитела. Об этом рассказали биохимики, выступавшие на конгрессе "Аутоиммунные и иммунодефицитные заболевания" в Москве.
    2605
  • 10/05/2018

    Эффективность лактаптина может быть повышена

    ​Разработчики противоракового средства нашли метод его адресной доставки к опухоли. Как рассказал заместитель директора Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН кандидат биологических наук Владимир Александрович Рихтер, лактаптин успешно прошел полный цикл доклинических испытаний и ожидает регистрации Минздрава РФ для перехода на последний, клинический этап.
    1840
  • 21/03/2016

    Ученые определят рак груди по анализу крови

    ​Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН занимаются исследованием маркеров, характерных для опухолевых клеток рака молочной железы (РМЖ), в составе циркулирующих в крови экзосом.
    2474
  • 12/08/2016

    Новосибирский ученый разработал новый метод генерации биспецифичных терапевтических антител

    ​Аспирант Новосибирского государственного университета Виктор Принц разработал новый метод генерации биспецифичных терапевтических иммуноглобулинов на основе процесса, который происходит в организме человека.
    3097
  • 12/11/2018

    Сибирские ингибиторы препаратов против рака проходят доклинические испытания

    ​Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирского института органической химии им. Н. Н. Ворожцова СО РАН и ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН» нашли эффективные белковые мишени для разработки препаратов против рака прямой кишки, легких и кишечника.
    1614
  • 15/03/2018

    Новосибирские ученые разрабатывают новое лекарство против клещевого энцефалита

    ​Молодой ученый Сибирского отделения РАН получил президентский грант. Новосибирец с коллегами занимается разработкой нового лекарства против клещевого энцефалита.  Два года назад журналисты ОТС уже рассказывали, что ученые проводили доклинические испытания на мышах и доказали: полученное лекарство в сотни раз эффективней иммуноглобулина и абсолютно нетоксично.
    1337
  • 02/09/2019

    Новосибирские учёные определяют эффективную терапию на раковых клетках

    Учёные новосибирского Академгородка предлагают оценивать эффективность терапии против раковых заболеваний крови по новой методике. Действие препаратов испытывают на злокачественных клетках в пробирке.
    1129
  • 05/09/2017

    ТОП-5 материалов августа на портале SIBMEDA

    Редакция SIBMEDA публикует рейтинг популярных, по мнению читателей, новостей и статей, размещенных на портале в августе.   1. Роспотребнадзор изымает из обращения два популярных анестетика из-за развития нежелательных реакций Роспотребнадзор сообщает о решении приостановить реализацию лекарственных препаратов «Лидокаин, раствор для инъекций 100 мг/мл 2 мл» и «Новокаин, раствор для инъекций 5 мг/мл 10 мл» в связи с развитием нежелательной реакции.
    1528
  • 19/04/2017

    Ученые установили, что управляет термогенезом

    ​Ранее считалось, что в термогенезе - процессе выработки тепла - ключевую роль играют макрофаги, один из видов белых клеток крови. Однако ученые из Школы медицины Икан на горе Синай (Icahn School of Medicine at Mount Sinai) в США во главе с профессором медицины Кристофом Бюттнером (Christoph Buettner) доказали, что за термогенез отвечает мозг.
    2019