Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с коллегами из Института систематики и экологии животных СО РАН уже много лет изучают геномы и генетику вируса клещевого энцефалита. Не так давно они исследовали коллекцию вирусов, выделенных на территории Новосибирского научного центра: наряду с известными генетическими вариантами вируса был найден новый. 

Существует три субтипа вируса клещевого энцефалита: восточный, европейский и сибирский, который широко представлен в нашем регионе. Недавно обнаруженный вариант (названный "Обским") соответствует последнему из них - правда, генетически "находка" отличается от уже известных вариантов вируса и близка к границе их разделения на субтипы.

- Разница между субтипами составляет 12 % по нуклеотидной последовательности, - рассказывает младший научный сотрудник ИХБФМ СО РАН кандидат биологических наук Сергей Евгеньевич Ткачев. - Оказалось, что новый штамм по своей генетической структуре близок к этой границе: он, конечно, сибирский субтип, но больше остальных похож и на другие типы. У него уникальная структура белков - точнее, некоторые варианты аминокислотных остатков в них не были описаны ранее, - что может влиять на биологические свойства данного варианта.

Ученые ИСиЭЖ СО РАН охарактеризовали новый вирус с точки зрения биологических свойств: по всей видимости, он является слабопатогенным - по крайней мере, для мышей штамм обладает низкой нейроинвазивностью (способностью проникать в мозг). Правда, патогенность для человека пока не известна.

Для каждого субтипа существуют прототипные штаммы - они были впервые описаны как соответствующий субтип, и на основе сравнения с ними можно понять, к какому типу относится изучаемый вирус. Кроме того считается, что различные субтипы вируса клещевого энцефалита отличаются по симптоматике заболевания: так, дальневосточный тяготеет к более тяжелой форме клещевого энцефалита, сибирский вызывает хроническую, а европейский является легко переносимым. Хотя на самом деле течение болезни определяют и особенности зараженного организма - например, иммунитет.

Оценка возраста вирусов данной группы показала, что они скорее всего относятся к наиболее древней линии среди сибирского субтипа. Обская линия была отделена от общего предка примерно 1,5 тыс. лет назад, что произошло даже раньше Балтийской - до этого она считалась самой старой.

- Чтобы узнать возраст новой линии, мы проанализировали полные геномы разных штаммов вируса клещевого энцефалита или их фрагменты, оценили скорость эволюции вируса и затем высчитали, в какой момент времени группа отделилась от предков, - добавляет Сергей Ткачев. - Пока на территории ННЦ мы обнаружили только один штамм данной линии. Также нашими коллегами из Москвы были найдены еще два вирусных изолята (выявленных фрагмента генома) в Кемерово, относящихся к Обской линии.

Так что паниковать из-за наличия нового варианта вируса рано - с учетом того, что у него вряд ли высокая патогенность. Однако полученные данные имеет смысл учитывать при создании тест-систем (уточняющих принадлежность вируса к определенному субтипу) или даже вакцин. С другой стороны, у ученых до сих пор нет однозначного вывода о том, является ли вакцина, созданная на основе дальневосточного или европейского штамма вируса клещевого энцефалита, в равной степени эффективной против сибирского субтипа.

Алена Литвиненко

Источники

Неведомый ранее "Обской" вирус клещевого энцефалита выявили новосибирские ученые
Ndn.info, 17/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый вариант вируса клещевого энцефалита
Наука в Сибири (sbras.info), 17/04/2018
Новый вид клещевого энцефалита обнаружен под Новосибирском
Все новости Новосибирской области (vn.ru), 17/04/2018
Новый вид клещевого энцефалита обнаружен под Новосибирском
Новости@Mail.ru, 17/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый вид клещевого энцефалита
Infopro54.ru, 17/04/2018
Новосибирские ученые открыли новый вид клещевого энцефалита
Google Новости ТОП, 17/04/2018
Новосибирские ученые открыли новый вид клещевого энцефалита
Сибкрай.ru (sibkray.ru), 17/04/2018
Новосибирские специалисты выявили новый вид клещевого энцефалита
RuNews24 (runews24.ru), 17/04/2018
Новосибирские ученые нашли новый штамм вируса клещевого энцефалита
Коммерсантъ # Иркутск.ru, 17/04/2018
Новосибирские ученые нашли новый штамм вируса клещевого энцефалита
Коммерсантъ # Новосибирск.ru, 17/04/2018
Новосибирские ученые нашли новый штамм вируса клещевого энцефалита
Коммерсантъ # Красноярск.ru, 17/04/2018
Новосибирские ученые открыли новый вид клещевого энцефалита
БезФормата.Ru Новосибирск (novosibirsk.bezformata.ru), 17/04/2018
На территории Новосибирска обнаружен новый вирус клещевого энцефалита с уникальной структурой белков
Sibmeda.ru, 17/04/2018
Новосибирские ученые нашли новый вид клещевого энцефалита
Официальный сайт г. Новосибирск (nsknews.info), 17/04/2018
Новый вид клещевого энцефалита обнаружен в Новосибирске
БК (bk54.ru), 17/04/2018
Новый вид клещевого энцефалита обнаружили новосибирские ученые
Kp.ru, 17/04/2018
В Новосибирске обнаружен новый вирус клещевого энцефалита
ВашГород.ру (vashgorod.ru), 17/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый генетический вариант вируса клещевого энцефалита
VN (vigornews.ru), 17/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый генетический вариант вируса клещевого энцефалита
Республика Татарстан (rt-online.ru), 17/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый генетический вариант вируса клещевого энцефалита
Google Новости ТОП, 17/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый генетический вариант вируса клещевого энцефалита
ТАСС, 17/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый генетический вариант вируса клещевого энцефалита
Mirtesen.sputnik.ru, 17/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый генетический вариант вируса клещевого энцефалита
ТАСС # Единая лента (Закрытая лента), 17/04/2018
В соседней с Омской Новосибирской области обнаружили новый вирус клещевого энцефалита
РЫБИНСКonLine (ryb.ru), 17/04/2018
На территории Новосибирска найден новый вирус клещевого энцефалита с необычайной структурой белков
Утренние новости (morning-news.ru), 17/04/2018
Найден обновленный вариант вируса клещевого энцефалита
Navkolo.me, 17/04/2018
Ученые обнаружили ранее неизвестный вариант клещевого энцефалита
Известия (iz.ru), 17/04/2018
В соседней с Омской Новосибирской области обнаружили новый вирус клещевого энцефалита
БезФормата.Ru Омск (omsk.bezformata.ru), 17/04/2018
Ученые обнаружили новый штамм вируса клещевого энцефалита
Доктор Питер (doctorpiter.ru), 17/04/2018
Обнаружен новый вариант вируса клещевого энцефалита
РЫБИНСКonLine (ryb.ru), 17/04/2018
Новый вид клещевого энцефалита: ученые Новосибирска назвали его "Обской"
Экология регионов (ekovolga.com), 17/04/2018
В соседней с Омской Новосибирской области обнаружили новый вирус клещевого энцефалита
Новый Омск (newsomsk.ru), 17/04/2018
Обнаружен новый штамм вируса клещевого энцефалита
Медицинский вестник (medvestnik.ru), 17/04/2018
Обнаружен новый вариант вируса клещевого энцефалита
123ru.net, 17/04/2018
Обнаружен новый вариант вируса клещевого энцефалита
Google Новости ТОП, 17/04/2018
Ученые выявили новый вид вируса клещевого энцефалита
Новости регионов России (skoronovosti.ru), 18/04/2018
В Сибири нашли новый вариант вируса клещевого энцефалита
Экология и жизнь (ecolife.ru), 18/04/2018
Ученые выявили новый вид вируса клещевого энцефалита
Телеканал 360, 18/04/2018
Найден новый вид вируса клещевого энцефалита
Спутник Новости (news.sputnik.ru), 18/04/2018
В Сибири отыскали обновленный вариант вируса клещевого энцефалита
Top Real Estate (topre.ru), 17/04/2018
Ученые обнаружили новый штамм вируса клещевого энцефалита
Новости регионов России (skoronovosti.ru), 17/04/2018
Новосибирские ученые обнаружили новый вид клещевого энцефалита
Народные новости (nation-news.ru), 17/04/2018
Ученые обнаружили новый штамм вируса клещевого энцефалита
БезФормата.Ru ЛенОбласть (lenoblast.bezformata.ru), 17/04/2018
Ученые обнаружили новый штамм вируса клещевого энцефалита
47 Новостей из Ленинградской области (47news.ru), 17/04/2018
Найден новый вид вируса клещевого энцефалита
СupofNews.ru, 17/04/2018
Найден новый вид вируса клещевого энцефалита
Ридус (ridus.ru), 17/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый вид клещевого энцефалита
Kremlin Press (kremlinpress.com), 17/04/2018
Новосибирские ученые обнаружили неизвестный вирус клещевого энцефалита | ИА КРАСНАЯ ВЕСНА
ИА Красная весна (rossaprimavera.ru), 17/04/2018
В Сибири нашли новый вариант вируса клещевого энцефалита
Российская газета (rg.ru), 17/04/2018
В Сибири нашли новый вариант вируса клещевого энцефалита
Google Новости ТОП, 17/04/2018
Новосибирские ученые нашли новый штамм вируса клещевого энцефалита
Google Новости ТОП, 17/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый вариант вируса клещевого энцефалита
Google Новости ТОП, 17/04/2018
Ученые обнаржили новый штамм вируса клещевого энцефалита
ЛИСток (listock.ru), 18/04/2018
Российские ученые открыли новый штамм клещевого энцефалита
Медицинское Обозрение (m-oboz.ru), 18/04/2018
Найден новый вид вируса клещевого энцефалита
Informburo.dn.ua, 18/04/2018
Опасный вид клеща, который мигрирует с Дальнего Востока России, пока не добрался до Омской области
Пресс-центр МКР Медиа (press.mkrmedia.ru), 18/04/2018
Ученые обнаружили новый штамм вируса клещевого энцефалита
Кировск online (kirovsk-online.ru), 18/04/2018
Обнаружен новый вариант вируса клещевого энцефалита
Rosinvest.com, 18/04/2018
Обнаружен новый вариант вируса клещевого энцефалита
Pcnews.ru, 18/04/2018
Российские ученые обнаружили новый подтип вируса энцефалита
Oane.ws, 18/04/2018
Сибирские ученые выявили новый штамм клещевого энцефалита
Лекобоз (lekoboz.ru), 18/04/2018
Новый вирус клещевого энцефалита нашли в Сибири
Sibnet.ru, 18/04/2018
Российские ученые обнаружили новый штамм вируса клещевого энцефалита
Google Новости ТОП, 18/04/2018
Российские ученые обнаружили новый штамм вируса клещевого энцефалита
Труд (trud.ru), 18/04/2018
В Сибири нашли новый вариант вируса клещевого энцефалита
Красноярский медицинский портал (krasgmu.net), 18/04/2018
Российские ученые открыли новый штамм клещевого энцефалита
Здоровье в России и мире (zdorowiye.ru), 18/04/2018
Найден новый вид вируса клещевого энцефалита
Телеграф (telegraf.lv), 18/04/2018
Российские ученые обнаружили новый подтип вируса энцефалита
Gazeta.kg, 19/04/2018
Обнаружен новый вариант вируса клещевого энцефалита
Новости всемирной сети (news-w.com), 19/04/2018
В Сибири обнаружен новый вариант клещевого энцефалита
Чердак (chrdk.ru), 19/04/2018
В России обнаружили новую разновидность клещевого энцефалита
Ufacitynews.ru, 19/04/2018
Ученые обнаружили новый генетический вариант вируса клещевого энцефалита
ДВ-РОСС (trud-ost.ru), 19/04/2018
В России обнаружен новый штамм вируса клещевого энцефалита
Русская планета (rusplt.ru), 19/04/2018
Новосибирские ученые обнаружили новый вариант вируса клещевого энцефалита - "Обской"
РИА Сибирь (ria-sibir.ru), 20/04/2018
Ученые обнаружили новый вариант вируса клещевого энцефалита
Вокруг света (vokrugsveta.ru), 22/04/2018
В России обнаружен самый древний тип энцефалита
Вести.ru, 21/04/2018
В России обнаружен самый древний тип энцефалита
SMIonline (so-l.ru), 21/04/2018
Это интересно. Новосибирские ученые открыли новый вид клещевого энцефалита
Природа Сибири (prirodasibiri.ru), 23/04/2018
Клещевой энцефалит: Новосибирские ученые обнаружили более древний и редкий вариант вируса
Kp.ru, 23/04/2018
В Сибири обнаружен новый вариант клещевого энцефалита
123ru.net, 23/04/2018
В Сибири обнаружен новый вариант клещевого энцефалита
News2 (news2.ru), 23/04/2018
Клещевой энцефалит: ученые обнаружили более древний и редкий вариант вируса
Медицинское Обозрение (m-oboz.ru), 23/04/2018
Новосибирские ученые обнаружили новый вариант вируса клещевого энцефалита. Более древний и редкий
Комсомольская правда # Москва, 25/04/2018
Обнаружен новый вариант вируса клещевого энцефалита
Nnov.org/corp/blogs/, 26/04/2018
Сибирские ученые обнаружили новый генетический вариант вируса клещевого энцефалита
Nanonewsnet.ru, 13/05/2018

Похожие новости

  • 25/03/2016

    Новосибирские ученые исследуют вирус с берегов Нила

    Сибирские ученые обнаружили в клещах, обитающих на территории Западной Сибири, вирус лихорадки Западного Нила. В ряде случаев, ее проявления совпадают с симптомами клещевого энцефалита. Изучение ВЗН ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН начали с прошлого года, когда к ним обратились коллеги-вирусологи из Омского НИИ Природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, занимавшиеся исследованиями  вируса клещевого энцефалита.
    1608
  • 19/01/2017

    Самые громкие и важные исследования ученых СО РАН за 2016 год по версии НГС

    Хомяки-математики, яд для лечения сердца, спасение от энцефалита и таяние льдов Гренландии — НГС.НОВОСТИ изучили самые громкие и важные исследования ученых СО РАН за последний год.  Новосибирцы гордятся Академгородком и славой научного центра Сибири, которую город получил благодаря институтам СО РАН и работающим в них ученым.
    1604
  • 17/08/2017

    Новосибирские ученые обнаружили реликтовый вид клещевого энцефалита

    ​Открытие принадлежит исследователям двух институтов - фундаментальной медицины и систематики животных (ИХБФМ СО РАН и ИСиЭЖ СО РАН). Обнаружили прародителя современного сибирского клещевого энцефалита.
    483
  • 24/10/2017

    Просветительская конференция NB.Revolution пройдет в Новосибирске

    ​После двухлетнего перерыва просветительская конференция NB.Revolution пройдет в Новосибирске, она начнется 28 октября в 11 часов утра в конференц-зале Центра культуры и отдыха "Победа". Об этом сообщает бессменный ее организатор и модератор Илья Кабанов, главный редактор интернет-альманаха metkere.
    940
  • 25/09/2016

    В новосибирском Академгородке пройдет фестиваль науки EUREKA!FEST

    ​Программа третьего по счету фестиваля науки EUREKA!FEST под общим названием "Споры будущего" поражает разнообразием и новизной форматов. Новосибирский государственный университет совместно с Фондом "Академгородок" является инициатором фестиваля и основной площадкой этого года.
    1209
  • 30/03/2017

    Новосибирские учёные предлагают бороться с колорадским жуком при помощи грибов и бактерий

    ​Учёные Института систематики и экологии животных СО РАН придумали, как бороться с колорадским жуком с помощью специальных паразитических грибов, бактерий и их метаболитов. Это поможет создать безопасный для природы и человека метод контроля численности вредителя.
    953
  • 20/06/2018

    Возможные перспективы Академгородка 2.0

    ​Ведущие ученые СО РАН продолжили обсуждение проектов развития научной инфраструктуры Новосибирского научного центра. Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова СО РАН выступил инициатором проекта «Сибирский центр малотоннажной химии».
    145
  • 05/09/2017

    ТОП-5 материалов августа на портале SIBMEDA

    Редакция SIBMEDA публикует рейтинг популярных, по мнению читателей, новостей и статей, размещенных на портале в августе.   1. Роспотребнадзор изымает из обращения два популярных анестетика из-за развития нежелательных реакций Роспотребнадзор сообщает о решении приостановить реализацию лекарственных препаратов «Лидокаин, раствор для инъекций 100 мг/мл 2 мл» и «Новокаин, раствор для инъекций 5 мг/мл 10 мл» в связи с развитием нежелательной реакции.
    456
  • 12/08/2016

    Новосибирский ученый разработал новый метод генерации биспецифичных терапевтических антител

    ​Аспирант Новосибирского государственного университета Виктор Принц разработал новый метод генерации биспецифичных терапевтических иммуноглобулинов на основе процесса, который происходит в организме человека.
    1382
  • 23/08/2017

    Коктейли из бактериофагов как замена антибиотиков

    ​В Институте химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН разрабатываются терапевтические препараты бактериофагов нового поколения, которые представляют собой мягкую и безопасную альтернативу антибиотикам.
    846