По результатам международного конкурса Brain Tumor Segmentation (BraTS) Challenge — 2020 (Сегментация опухоли головного мозга) мультидисциплинарная команда из новосибирских ученых, в состав которой вошли научные сотрудники лаборатории аналитики потоковых данных и машинного обучения Механико-математического факультета НГУ, практикующие врачи Федерального центра нейрохирургии и руководитель Научно-исследовательского института клинической и экспериментальной лимфологии — филиала ИЦиГ СО РАН, получила подтверждение и признание разрабатываемых методов и подходов анализа медицинских данных в виде публикации.
 
Соревнование BraTS проводится уже несколько лет и специализируется на глиомах высокой и низкой степени злокачественности (HGG и LGG). В этом году в рамках конкурса были поставлены задачи: cегментация опухолей головного мозга; прогнозирование общей выживаемости пациентов на основе предоперационных МРТ-томограмм; оценка мер неопределенности при сегментации. 
 
— Наша команда «NSU_BTR» сфокусировалась на первой и третьей задачах. В ходе работ мы провели более 100 экспериментов. Использовались собственные оригинальные методы, в основе которых лежит подход к обработке МРТ-снимков, использующий основные последовательности Т1-ВИ, Т1-контраст, T2-ВИ и T2-Flair. Основная цель участия в международных соревнованиях — сравнение с лучшими практиками и проверка собственных подходов, — отметил заведующий лабораторией аналитики потоковых данных и машинного обучения ММФ НГУ Баир Тучинов
 
По итогам соревнования были получены положительные результаты на стадии валидации (проверки), и организаторы предложили команде НГУ опубликовать статью в издании Springer Nature. Полученный опыт и наработки используются в основном научном проекте «Разработка технологии персонализированной диагностики и выработки рекомендаций по лечению нейроонкологических заболеваний с применением методов нейровизуализации на основе систем искусственного интеллекта (глубокого машинного обучения)», поддержанным РФФИ
 
На данный момент по результатам выполнения проекта опубликовано 7 статей и еще 3 находятся в процессе рецензирования. 

 
— Текущие результаты можно использовать для персонализированной диагностики: раннего обнаружения и классификации новообразований, прогнозирования состояний и выборе тактики лечения, — комментирует руководитель проекта — известный радиолог, доктор медицинских наук, профессор Андрей Летягин.
 
***
Brain Tumor Segmentation and Associated Uncertainty Evaluation Using Multi-sequences MRI Mixture Data Preprocessing (Сегментация опухоли головного мозга и оценка связанной с ней неопределенности с использованием предварительной обработкой смешанных данных нескольких МРТ-последовательностей). 

Похожие новости

  • 26/03/2021

    Новая модель наследования человеческого роста

    Группа ученых из России предложила новую модель для изучения наследования роста человека, позволяющую учитывать взаимодействие между разными факторами, оказывающими влияние на рост. Результаты исследования опубликованы в журнале European Journal of Human Genetics.
    747
  • 15/05/2019

    Сибирские ученые придумали, как быстро и просто анализировать форму клеток эпидермиса листьев у растений

    ​Сотрудники ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН» совместно с коллегами из Института систем информатики им. А. П. Ершова СО РАН и Новосибирского государственного университета разработали программу LSM-W2, которая позволяет извлекать данные о морфологии поверхности листа из изображений, полученных с применением лазерного сканирующего микроскопа.
    1142
  • 23/04/2021

    Академпарк новосибирского научного центра представил новые технологии сити-фермерства

     Технологии сити-фермерства – выращивания в условиях искусственного микроклимата в вертикальных фермах овощных культур и клубники, а также микрозелени и съедобных цветов, 23 апреля в ходе пресс-тура в Академпарк Новосибирского научного центра (ННЦ) представлены заместителю Губернатора Новосибирской области Ирине Мануйловой и представителям СМИ региона.
    894
  • 08/11/2019

    Вернуть утраченное: как клетки растений реагируют на повреждения

    Российская исследовательница вместе с сингапурским коллегой обобщили данные о регенерации тканей у растений на уровне отдельных клеток. Ученые отмечают, что благодаря современным технологиям появились наблюдения о том, что восстановление может происходить не только за счет стволовых клеток, но и благодаря ассиметричному (регенеративному) делению других типов клеток, находящихся вокруг поврежденной зоны.
    1572
  • 18/04/2019

    «Цифровизация диабетологии»: какие задачи решают «большие данные»

    ​Компьютерная обработка и анализ больших массивов данных (big data) находят все более широкое применение как в исследовательской биологии, так и в клинической медицине. Не является исключением и диабетология.
    894
  • 27/12/2017

    Исследователи реализуют проект, позволяющий исправлять мутации ДНК митохондрий

    ​В последнее время все чаще можно услышать о тяжелых наследственных заболеваниях митохондриальной этиологии. Эти недуги вызываются дефектами митохондрий, которые являются своеобразными "энергетическими станциями" клеток организма.
    3272
  • 24/11/2020

    Клеточные технологии помогают в лечении трофических язв

    ​​Сахарным диабетом страдают сотни миллионов обитателей нашей планеты. И по прогнозам экспертов, их число в ближайшие десятилетия заметно вырастет. Одно из распространенных последствий развития этого заболевания - трофические язвы нижних конечностей.
    579
  • 31/05/2016

    Новосибирские ученые исследуют кровеносную систему

    ​Кровеносная система лежит в основе функционирования головного мозга, и в области её работы ещё много «белых» пятен. Сибирские учёные в сотрудничестве с медиками решили устранить некоторые из них.  Исследование имеет и прикладной выход: уже создана уникальная система мониторинга нейрохирургических операций, метод повышения качества магнитно-резонансной томографии, а также инструментарий для персонализированного моделирования протекания некоторых болезней.
    4846
  • 05/08/2021

    Климат и экология

    О том, как идет подготовка к VIII Международному форуму технологического развития, до которого осталось меньше месяца, на минувшей неделе рассказал министр науки и инновационной политики Новосибирской области Алексей Васильев.
    2300
  • 30/08/2021

    Генетические технологии: что сделать, чтобы обеспечить прорыв?

    Генетические технологии находятся на пике популярности уже не первое десятилетие. Количество исследований и секвенированных геномов растет стремительно, в то же время с внедрением разработок в жизнь до сих пор возникают проблемы.
    175