13/04/2016
ИЦиГ СО РАН
В ИЦИГ СО РАН создают базу данных для обработки научной информации
1643
В Федеральном исследовательском центре «Институт цитологии и
генетики СО РАН» разрабатывают универсальную систему для поддержки
селекционно-генетических экспериментов, пока что тестируя ее на
проектах, связанных с изучением пшеницы.
— В нашем институте работает много научных групп, и каждая из них
использует свои протоколы и методы, — говорит научный сотрудник
лаборатории эволюционной биоинформатики и теоретической генетики ИЦиГ СО
РАН кандидат биологических наук Михаил Генаев. — Так, к примеру, вес
плодов измеряется для куста, делянки, одной тысячи зерен (для пшеницы,
овса) или грозди (для винограда), в зрелом состоянии или по истечению
определенного срока с момента высадки.
Замеры так же могут производиться несколькими способами, с неодинаковой точностью и в отличающихся условиях. В такой ситуации сведения, полученные при различных опытах, как правило, не способны быть корректно использованы для анализа в других работах. Поэтому задача нашей информационной системы — обеспечить накопление и эффективную систематизацию получаемых в ходе различных экспериментов данных для их последующего применения в других исследовательских и практических целях.
Замеры так же могут производиться несколькими способами, с неодинаковой точностью и в отличающихся условиях. В такой ситуации сведения, полученные при различных опытах, как правило, не способны быть корректно использованы для анализа в других работах. Поэтому задача нашей информационной системы — обеспечить накопление и эффективную систематизацию получаемых в ходе различных экспериментов данных для их последующего применения в других исследовательских и практических целях.
Многие из работ — например, связанные с урожайностью пшеницы, являются
сезонными, и их необходимо повторять каждый год. Следуя подсказкам новой
системы, все необходимые операции с растениями в состоянии выполнить
даже студент, только начинающий свой путь в науке. Также ученый имеет
возможность прикрепить к каждому растению бирку с QR-кодом, который
затем будет внесен в базу данных и ассоциирован с тем или иным
экспериментом. Потом с помощью смартфона код можно сосканировать и
получить всю информацию о выполненных и предстоящих изысканиях.
Михаил Генаев утверждает, что новый подход к структурированию
информации поможет в селекции высокоурожайных и устойчивых к
неблагоприятному климату растений. В такой работе особенно важно
проводить статистический анализ тысяч образцов, выделяя связь между
фенотипическими признаками — например, засухоустойчивостью — и теми
генами, которые за них отвечают.
Похожие новости
15/05/2019
Сибирские ученые придумали, как быстро и просто анализировать форму клеток эпидермиса листьев у растений
Сотрудники ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН» совместно с коллегами из Института систем информатики им. А. П. Ершова СО РАН и Новосибирского государственного университета разработали программу LSM-W2, которая позволяет извлекать данные о морфологии поверхности листа из изображений, полученных с применением лазерного сканирующего микроскопа.
180
180
06/04/2016
Мобильные приложения - для ускорения фундаментальных исследований
В Федеральном исследовательском центре «Институт цитологии и генетики (ИЦиГ СО РАН) СО РАН» разработаны компьютерные программы для экспресс-анализов злаковых в полевых условиях: приложения для массового фенотипирования зерен пшеницы и опушения листа (трихом).
1466
1466
19/11/2018
Биолог из Новосибирска разработал мобильное приложение для сельского хозяйства
Труд агрономов и селекционеров иногда содержит очень утомительные операции. Например, периодически им требуется подсчитывать количество зерен в колосьях пшеницы. Не делать этого вручную позволяет мобильное приложение SeedCounter, которое вместе с коллегами создал биолог Михаил Генаев из Новосибирска.
314
314
18/04/2019
«Цифровизация диабетологии»: какие задачи решают «большие данные»
Компьютерная обработка и анализ больших массивов данных (big data) находят все более широкое применение как в исследовательской биологии, так и в клинической медицине. Не является исключением и диабетология.
217
217
27/07/2017
Учёные ИЛФ СО РАН разрабатывают методы диагностики диабета с помощью терагерцового излучения
Исследователи из Института лазерной физики СО РАН развивают метод импульсной терагерцовой спектроскопии для диагностики сахарного диабета по характеристикам воды в плазме крови. Также учёные работают над созданием технологии неинвазивного определения этого заболевания.
1164
1164
25/08/2016
Новосибирские генетики создали маркер для обнаружения раковых клеток
В Новосибирске научились определять среди клеток рака "ключевых убийц", виновных в возникновении опухолей. Однако без господдержки маркер не сможет послужить людям.Ученые всего мира ищут способ победить рак, пытаясь создать препарат, с помощью которого можно отслеживать и помечать опасные клетки.
1894
1894
05/12/2016
Сибирские генетики и управление фотосинтезом
Ученые Новосибирского государственного университета и Института цитологии и генетики СО РАН отвечают на вопрос о том, как на генетическом уровне регулируется синтез и распределение хлорофилла в разных органах растений, исследуя геномы обычного ячменя и ячменя частичного альбиноса, у которого нарушена выработка хлорофилла.
2130
2130
07/03/2018
Ученые установили, что длительные конфликты изменяют строение мозга
Ученые из Института цитологии и генетики Сибирского отделения РАН показали, что у самцов мышей, 20 дней находившихся в условиях постоянных конфликтов с враждебно настроенными представителями своего же вида, в различных отделах мозга повышается или снижается экспрессия генов семейства коллагена.
642
642
10/11/2016
О перспективных направлениях исследований в области биоэнергетики
Academcity продолжает анонсировать инновационные решения, которые будут представлены на форуме "Инновационная энергетика". Сегодня предлагается ознакомиться с перспективным направлением исследований в области биоэнергетики.
1453
1453
28/08/2018
Новосибирские ученые создали прибор для диагностики заболеваний печени на ранней стадии
Уникальный аппарат для диагностики заболевания печени на ранней стадии с помощью глубокого зондирования клеток разработали ученые Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии (ГНЦ ВБ) "Вектор" Роспотребнадзора и двух научных институтов Сибирского отделения РАН, сообщил в понедельник в рамках Международного форума "Технопром-2018" в Новосибирске ведущий научный сотрудник ГНЦ ВБ "Вектор" Владимир Генералов.
481
481