13/04/2016
ИЦиГ СО РАН

В ИЦИГ СО РАН создают базу данных для обработки научной информации

1418

​В Федеральном исследовательском центре «Институт цитологии и генетики СО РАН» разрабатывают универсальную систему для поддержки селекционно-генетических экспериментов, пока что тестируя ее на проектах, связанных с изучением пшеницы.

— В нашем институте работает много научных групп, и каждая из них использует свои протоколы и методы, — говорит научный сотрудник лаборатории эволюционной биоинформатики и теоретической генетики ИЦиГ СО РАН кандидат биологических наук Михаил Генаев. — Так, к примеру, вес плодов измеряется для куста, делянки, одной тысячи зерен (для пшеницы, овса) или грозди (для винограда), в зрелом состоянии или по истечению определенного срока с момента высадки.

Замеры так же могут производиться несколькими способами, с неодинаковой точностью и в отличающихся условиях. В такой ситуации сведения, полученные при различных опытах, как правило, не способны быть корректно использованы для анализа в других работах. Поэтому задача нашей информационной системы — обеспечить накопление и эффективную систематизацию получаемых в ходе различных экспериментов данных для их последующего применения в других исследовательских и практических целях. 
 
Многие из работ — например, связанные с урожайностью пшеницы, являются сезонными, и их необходимо повторять каждый год. Следуя подсказкам новой системы, все необходимые операции с растениями в состоянии выполнить даже студент, только начинающий свой путь в науке. Также ученый имеет возможность прикрепить к каждому растению бирку с QR-кодом, который затем будет внесен в базу данных и ассоциирован с тем или иным экспериментом. Потом с помощью смартфона код можно сосканировать и получить всю информацию о выполненных и предстоящих изысканиях. 
 
Михаил Генаев утверждает, что новый подход к структурированию информации поможет в селекции высокоурожайных и устойчивых к неблагоприятному климату растений. В такой работе особенно важно проводить статистический анализ тысяч образцов, выделяя связь между фенотипическими признаками — например, засухоустойчивостью — и теми генами, которые за них отвечают.

Похожие новости

  • 06/04/2016

    Мобильные приложения - для ускорения фундаментальных исследований

    ​В Федеральном исследовательском центре «Институт цитологии и генетики (ИЦиГ СО РАН) СО РАН» разработаны компьютерные программы для экспресс-анализов злаковых в полевых условиях: приложения для массового фенотипирования зерен пшеницы и опушения листа (трихом).
    1246
  • 28/08/2018

    Новосибирские ученые создали прибор для диагностики заболеваний печени на ранней стадии

    ​Уникальный аппарат для диагностики заболевания печени на ранней стадии с помощью глубокого зондирования клеток разработали ученые Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии (ГНЦ ВБ) "Вектор" Роспотребнадзора и двух научных институтов Сибирского отделения РАН, сообщил в понедельник в рамках Международного форума "Технопром-2018" в Новосибирске ведущий научный сотрудник ГНЦ ВБ "Вектор" Владимир Генералов.
    211
  • 27/07/2017

    Учёные ИЛФ СО РАН разрабатывают методы диагностики диабета с помощью терагерцового излучения

    Исследователи из Института лазерной физики СО РАН развивают метод импульсной терагерцовой спектроскопии для диагностики сахарного диабета по характеристикам воды в плазме крови. Также учёные работают над созданием технологии неинвазивного определения этого заболевания.
    811
  • 25/08/2016

    Новосибирские генетики создали маркер для обнаружения раковых клеток

    ​В Новосибирске научились определять среди клеток рака "ключевых убийц", виновных в возникновении опухолей. Однако без господдержки маркер не сможет послужить людям.Ученые всего мира ищут способ победить рак, пытаясь создать препарат, с помощью которого можно отслеживать и помечать опасные клетки.
    1584
  • 07/03/2018

    Ученые установили, что длительные конфликты изменяют строение мозга

    Ученые из Института цитологии и генетики Сибирского отделения РАН показали, что у самцов мышей, 20 дней находившихся в условиях постоянных конфликтов с враждебно настроенными представителями своего же вида, в различных отделах мозга повышается или снижается экспрессия генов семейства коллагена.
    404
  • 03/02/2016

    Для чего ученые красят пшеницу?

    ​​​​Ученые Федерального исследовательского центра "Институт цитологии и генетики СО РАН" (ИЦиГ СО РАН) ищут новые пути повышения устойчивости ведущих злаковых культур к неблагоприятным условиям, а также работают над повышением питательных свойств зерна пшеницы.
    2986
  • 10/11/2016

    О перспективных направлениях исследований в области биоэнергетики

    ​Academcity продолжает анонсировать инновационные решения, которые будут представлены на форуме "Инновационная энергетика". Сегодня предлагается ознакомиться с перспективным направлением исследований в области биоэнергетики.
    1194
  • 13/01/2016

    Татьяна Толстикова: "В СО РАН есть все предпосылки, чтобы решить проблему импортозамещения лекарств"

    ​Доктор биологических наук, профессор Татьяна Генриховна Толстикова возглавляет лабораторию Новосибирского института органической химии им. Н.Н. Ворожцова (НИОХ) СО РАН - уникальную для России структуру.
    2319
  • 20/06/2018

    От стресса до аутизма - один шаг?

    В секторе нейрогенетики социального поведения ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН» под руководством д.б.н. Наталии Кудрявцевой разработали уникальную методику, позволяющую моделировать механизмы формирования неврологических расстройств.
    278
  • 05/12/2016

    Сибирские генетики и управление фотосинтезом

    ​Ученые Новосибирского государственного университета и Института цитологии и генетики СО РАН отвечают на вопрос о том, как на генетическом уровне регулируется синтез и распределение хлорофилла в разных органах растений, исследуя геномы обычного ячменя и ячменя частичного альбиноса, у которого нарушена выработка хлорофилла.
    1728