В Федеральном исследовательском центре «Институт цитологии и
генетики СО РАН» разрабатывают универсальную систему для поддержки
селекционно-генетических экспериментов, пока что тестируя ее на
проектах, связанных с изучением пшеницы.
— В нашем институте работает много научных групп, и каждая из них
использует свои протоколы и методы, — говорит научный сотрудник
лаборатории эволюционной биоинформатики и теоретической генетики
ИЦиГ СО
РАН кандидат биологических наук Михаил Генаев. — Так, к примеру, вес
плодов измеряется для куста, делянки, одной тысячи зерен (для пшеницы,
овса) или грозди (для винограда), в зрелом состоянии или по истечению
определенного срока с момента высадки.
Замеры так же могут производиться
несколькими способами, с неодинаковой точностью и в отличающихся
условиях. В такой ситуации сведения, полученные при различных опытах,
как правило, не способны быть корректно использованы для анализа в
других работах. Поэтому задача нашей информационной системы — обеспечить
накопление и эффективную систематизацию получаемых в ходе различных
экспериментов данных для их последующего применения в других
исследовательских и практических целях.
Многие из работ — например, связанные с урожайностью пшеницы, являются
сезонными, и их необходимо повторять каждый год. Следуя подсказкам новой
системы, все необходимые операции с растениями в состоянии выполнить
даже студент, только начинающий свой путь в науке. Также ученый имеет
возможность прикрепить к каждому растению бирку с QR-кодом, который
затем будет внесен в базу данных и ассоциирован с тем или иным
экспериментом. Потом с помощью смартфона код можно сосканировать и
получить всю информацию о выполненных и предстоящих изысканиях.
Михаил Генаев утверждает, что новый подход к структурированию
информации поможет в селекции высокоурожайных и устойчивых к
неблагоприятному климату растений. В такой работе особенно важно
проводить статистический анализ тысяч образцов, выделяя связь между
фенотипическими признаками — например, засухоустойчивостью — и теми
генами, которые за них отвечают.