​​Ученые научно-исследовательской лаборатории «Гербарий» Томского государственного университета (ТГУ) вместе с коллегами из Польши и Германии впервые получили геном самого распространенного степного ковыля. Это растение используется для восстановления почв и служит важным маркером изменения климата. Работа биологов была опубликована в авторитетном журнале Scientific Reports издательства Springer Nature. 

 
Евразийское растение Stipa capillata — наиболее часто встречающийся в степях вид ковыля. Некоторые виды ковыля имеют экономическое значение, используются для восстановления почв и как корм для домашнего скота. Растение также применяется в исследованиях, связанных с изменением климата. Несмотря на то, что начали появляться крупномасштабные молекулярные данные, до сих пор не было полного или чернового (драфтового) генома ни для одного вида Stipa. 

 
Исследованием первого драфтового генома ковыля с использованием SMRT-секвенирования занималась международная команда, в состав которой вошли сотрудники лаборатории ТГУ Полина Гудкова и Евгений Баяметов, ученые Марчин Нобис из Ягеллонского университета в Кракове, Цервин Гуйомар и Екатерина Шелест из Немецкого центра интегративного исследования биоразнообразия в Лейпциге. Как отмечают авторы работы, важность получения генома в том, что это зачастую может послужить первым шагом к пониманию многих фундаментальных процессов, лежащих в основе эволюции. 

 
Томские биологи уже более семи лет применяют в изучении ковылей различные методы молекулярно-генетических исследований в комплексе с классическими. По словам Полины Гудковой, с переходом на более сложные технологии возникла необходимость иметь геном изучаемого растения. Но такой способ как полногеномное секвенирование очень дорогой и трудоемкий. Он был доступен только для экономически важных растений, таких как пшеница или рис. Однако два года назад лаборатории удалось получить финансирование на свой проект. 

 
С помощью процесса секвенирования третьего поколения PacBio биологи получили драфтовый вариант генома размером около одного миллиарда нуклеотидов, содержащий примерно 80 тыс. генов. Результатом работы исследователей также стал значительный набор генетических данных, которые могут быть использованы для филогенетического анализа, изучения явлений гибридизации и популяционных процессов как на уровне рода, так и на уровне семейства злаков. Будущая цель ученых ТГУ — получить полный геном ковыля на уровне хромосом и прояснить эволюционные события в трибе Stipae. 

 
Источник: ​www.minobrnauki.gov.ru

Источники

Томские биологи в сотрудничестве с иностранными коллегами получили геном ковыля
Министерство науки и высшего образования РФ (minobrnauki.gov.ru), 05/08/2021
Томские ученые получили геном ковыля, используемого в изучении климата
Российская газета. СФО (rg.ru), 06/08/2021
Томские ученые получили геном ковыля, используемого в изучении климата
Рамблер/новости (news.rambler.ru), 06/08/2021
Сотрудники Гербария ТГУ впервые расшифровали геном ковыля
Томский государственный университет (tsu.ru), 09/08/2021
Ученые ТГУ с иностранными коллегами впервые расшифровали геном ковыля
РИА Томск (riatomsk.ru), 09/08/2021
Сотрудники Гербария ТГУ впервые расшифровали геном ковыля
Informio.ru, 09/08/2021
Сотрудники Гербария ТГУ впервые расшифровали геном ковыля
Поиск (poisknews.ru), 09/08/2021
Сотрудники Гербария ТГУ впервые расшифровали геном ковыля
Российский научный фонд (rscf.ru), 09/08/2021
Сотрудники Гербария ТГУ впервые расшифровали геном ковыля
Российский научный фонд (рнф.рф), 09/08/2021
Сотрудники Гербария томского вуза впервые расшифровали геном степного растения
Томское время (tomsk-time.ru), 09/08/2021
Томские ученые с зарубежными коллегами впервые расшифровали геном ковыля
В Томске (vtomske.ru), 16/08/2021

Похожие новости

  • 31/08/2021

    Интервью с Денисом Касымовым о развитии системы предотвращения пожаров

    Ситуация с пожарами в мире не утихает. С каждым годом в лесных массивах их становится всё больше. Причин этой глобальной проблемы много. Непотушенная сигарета, спичка, костёр; выброшенная стеклянная бутылка, которая может стать линзой; сжигание старой травы, различного мусора возле леса.
    306
  • 01/09/2021

    Гендиректор СХК познакомился с прорывными научными тематиками ТПУ

    ​Томский политехнический университет посетила делегация АО «Сибирский химический комбинат». Возглавил ее генеральный директор предприятия, выпускник ТПУ Сергей Котов. C и.о. ректора Томского политеха Дмитрием Седневым они обсудили перспективные направления сотрудничества между вузом и СХК.
    255
  • 15/12/2020

    Международная команда физиков изучила радиационные свойства озона

    ​​Полученные результаты помогут осуществлять контроль качества озонового слоя, который участвует в формировании атмосферы и климата Земли, влияет на качество воздуха, охраняет планету от жесткого ультрафиолетового излучения.
    703
  • 10/03/2021

    Изучение планктона цифровой голографической камерой поможет экологии

    Ученые лаборатории радиофизических и оптических методов изучения окружающей среды РФФ ТГУ нашли способ определять загрязнения водоемов по планктону. Основной инструмент – цифровая голографическая камера.
    490
  • 20/09/2021

    Дно рижского порта очистят с помощью инновационной технологии Аэрощуп

    Биологи Томского государственного университета совместно с компанией PurOceans Technology, созданной в ЕС при участии ТГУ, проведут в порту Риги опытно-промышленные испытания технологии «Аэрощуп». Инновационный подход, разработанный в ТГУ, будет использован для очистки донных отложений портовой зоны от нефти и нефтепродуктов.
    173
  • 03/07/2020

    Мегагранты: чем занимаются лаборатории, открытые в рамках программы

    Программа мегагрантов была запущена в 2010 году. Она подразумевает международное сотрудничество российских вузов и научных организаций с ведущими зарубежными учеными и научно-образовательными центрами в сферах науки, образования и инноваций.
    2922
  • 07/06/2021

    Новые компании и университеты присоединились в Консорциуму водородных технологий

    ​К работе Консорциума водородных технологий присоединилась новые участники. Это шесть российских университетов, ведущих исследования в области водородных технологий, и пять отечественных компаний. Решение о включении новых участников было принято в четверг, 3 июня, на заседании Координационного совета консорциума.
    1291
  • 29/12/2020

    Наталья Гусева: «2020 год потребовал самоотверженности и готовности к переменам»

    ​Директор Инженерной школы природных ресурсов ТПУ Наталья Гусева поделилась результатами, которых достиг коллектив школы в 2020 году, и рассказала о целях и задачах на будущий год.​   Уходящий год стал точкой отсчета новой реальности для всего мира, и, чтобы в нее «встроиться», нам пришлось многое пересмотреть и изменить в своей деятельности.
    1704
  • 04/08/2021

    Эксперт ТПУ рассказал о Консорциуме водородных технологий на интенсиве «Архипелаг 2021»

    ​Директор Инженерной школы природных ресурсов Томского политеха Артем Боев стал участником экспертной сессии, посвященной водородной энергетике — новому направлению технологического развития.Мероприятие в рамках проектно-образовательного интенсива по подготовке команд в сфере сквозных технологий «Архипелаг 2121» собрало экспертов из разных сфер и отраслей: профильных министерств, крупных индустриальных компаний, представителей регионов России.
    1343
  • 11/04/2019

    Ученые ТПУ изучают, чем загрязнена река в промышленном районе Индии

    ​Исследователи Томского политехнического университета (ТПУ) привезли пробы воды из Дамодара – одной из самых грязных рек Индии; изучив состав и миграцию вредных веществ, политехники вместе с коллегами из России, Китая и Индии намерены предложить меры по очистке и предотвращению дальнейшего загрязнения реки, сообщила пресс-служба вуза.
    2081