Ученые Сибирского федерального университета (СФУ) полностью расшифровали геном сибирской лиственницы, разработав и применив для этого уникальную методику поэтапной сборки генома "по частям". Полученные данные позволят эффективнее культивировать это дерево, имеющее важное экономическое и экологическое значение, сообщила в пятницу пресс-служба Министерства науки и высшего образования РФ.

 
Геномы хвойных имеют громадный размер, который в 4-9 раз превышает геном человека. Для их расшифровки требуются специальные подходы, как при постановке эксперимента, так и при проведении вычислений. На сегодняшний день только две команды ученых в мире смогли расшифровать геном хвойного дерева.

 
"Группа исследователей лаборатории лесной геномики научно-образовательного центра геномных исследований СФУ провела секвенирование, сборку и аннотацию ядерного, митохондриального и хлоропластного геномов сибирской лиственницы - одного из важнейших представителей бореальных хвойных лесов, имеющего важное экономическое и экологическое значение", - говорится в сообщении. Исследование проводилось на средства мегагранта "Геномные исследования основных бореальных лесообразующих хвойных видов и их наиболее опасных патогенов в РФ".

 
Методика, которую разработали ученые СФУ для расшифровки генома лиственницы, позволяет осуществлять относительно быструю сборку очень больших геномов на сравнительно небольших объемах вычислительных ресурсов. В ее основе - принцип поэтапной сборки генома "по частям", которая позволяет обойти ограничения современных ассемблеров (сборщиков генов) при вводе большого объема данных. Так, геном лиственницы состоит из 12 млрд нуклеотидных оснований.

 
Полученные данные, как отмечают ученые, закладывает основу для проведения многих исследований, вплоть до создания базы данных лесных генетических ресурсов для использования в лесном хозяйстве. Например, они позволят контролировать посевной материал для восстановления лесов и использовать те деревья, которые оптимальны для конкретных экологических условий.

 
"В перспективе - это переход от традиционной селекции к геномной. Такая база данных будет востребована для идентификации происхождения растительного материала в борьбе с нелегальными рубками и нелегальным оборотом древесины. Новые знания о геномах хвойных также являются фундаментом для последующих исследований эволюционных, биохимических и физиологических процессов в этих организмах", - сообщил заведующий лаборатории лесной геномики и НОЦ геномных исследований СФУ Константин Крутовский, слова которого приводятся в сообщении.
 
***
 
Результаты исследований опубликованы в авторитетном журнале BMC Bioinformatics в статье «Stepwise large genome assembly approach: a case of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb)». Статья открывает цикл материалов, посвящённых полногеномным исследованиям основных российских хвойных видов.
 

Источники

Сибирские ученые расшифровали геном лиственницы
Krasnoyarsk.4geo.ru, 15/02/2019
Сибирские ученые расшифровали геном лиственницы
The world news (theworldnews.net), 15/02/2019
Сибирские ученые расшифровали геном лиственницы
Новости@Rambler.ru, 15/02/2019
Сибирские ученые расшифровали геном лиственницы
Российская газета (rg.ru), 15/02/2019
Сибирские ученые расшифровали геном лиственницы
SMIonline (so-l.ru), 15/02/2019
Сибирские ученые расшифровали геном лиственницы
MaxNews (maxnews.net), 15/02/2019
Геном лиственницы расшифрован красноярскими учеными
Anonsens.ru, 17/02/2019
Ученые из Красноярска расшифровали геном лиственницы
TOP NEWS (mytopnews.ru), 17/02/2019
Красноярские ученые смогли первыми расшифровать геном лиственницы
RuNews24 (runews24.ru), 17/02/2019
Ученые из Красноярска расшифровали геном лиственницы
Krasnoyarsk.4geo.ru, 16/02/2019
Ученые из Красноярска расшифровали геном лиственницы
Новости@Rambler.ru, 16/02/2019
Ученые из Красноярска расшифровали геном лиственницы
Мир24 (mir24.tv), 16/02/2019
Ученые из Красноярска расшифровали геном лиственницы
News.hi.ru, 16/02/2019
Сибирские ученые полностью расшифровали геном лиственницы. Это может помочь, например, в борьбе с нелегальными вырубками
Проспект Мира (prmira.ru), 17/02/2019
Красноярские ученые расшифровали геном лиственницы
HOLME SPACE (holme.ru), 17/02/2019
Красноярские ученые расшифровали геном лиственницы
Московский Комсомолец # Красноярск (kras.mk.ru), 17/02/2019
Исследование. Сибирские ученые расшифровали геном лиственницы
Природа Сибири (prirodasibiri.ru), 17/02/2019
Ученые РФ расшифровали геном сибирской лиственницы, применив свою уникальную методику
Официальный сайт Министерства науки и высшего образования Российской Федерации, 15/02/2019
Ученые Сибирского федерального университета первыми расшифровали геном лиственницы и сосны.
Сибирь Информ (sibfo.ru), 18/02/2019
Красноярские ученые расшифровали геномы лиственницы и сосны
Kgs.ru, 18/02/2019
Красноярские ученые расшифровали геномы лиственницы и сосны
Сибирское агентство новостей (sibnovosti.ru), 18/02/2019
Красноярские ученые расшифровали геномы лиственницы и сосны
REDom (redom.ru), 18/02/2019
Красноярские ученые расшифровали геномы лиственницы и сосны
Новости@Rambler.ru, 18/02/2019
Ученые расшифровали геном сибирской лиственницы
Ракурс 360 (racurs360.ru), 18/02/2019
Расшифровка генома лиственницы генетиками СФУ стала результатом мирового значения
Научно-инновационный портал СФУ (research.sfu-kras.ru), 18/02/2019
В Красноярске расшифровали геном лиственницы
The world news (theworldnews.net), 18/02/2019
В Красноярске расшифровали геном лиственницы
ИА Regnum, 18/02/2019
Красноярские ученые расшифровали геномы лиственницы и сосны
РИА Сибирь (ria-sibir.ru), 19/02/2019

Похожие новости

  • 14/12/2018

    Красноярские ученые оценили эффективность различных методик отбора образцов древесины для датировки

    ​Экологи из Сибирского федерального университета (СФУ) оценили эффективность различных методик отбора образцов древесины для датировки и изучения климата прошлого. Исследование поддержано грантами Российского научного фонда (1, 1).
    912
  • 14/07/2017

    Ученые СФУ будут отслеживать изменения климата по кольцам тибетских деревьев

    ​Международная группа исследователей с участием российских ученых из Сибирского федерального университета (СФУ) разработала эффективный метод оценки влияния климатических изменений на развитие растений, основанный на математическом моделировании, сообщила пресс-служба СФУ.
    956
  • 14/12/2017

    Сибирские геофизики объяснили озоновую дыру естественными причинами

    ​Ученые Сибирского федерального университета сравнили состояние содержание озона в Северном полушарии по спутниковым данным и выдвинули новую гипотезу возникновения Антарктической озоновой дыры. Результаты исследования опубликованы в "Журнале Сибирского федерального университета".
    666
  • 26/09/2018

    Разработан эффективный способ получения бактериальной целлюлозы

    ​Российские ученые разработали эффективный способ производства бактериальной целлюлозы из штамма чайного гриба. Они определили условия и методы выращивания бактерий, которые позволяют получить большее количество пленок этого вещества.
    466
  • 15/08/2017

    К чему ведет редактирование генома

    ​Недавно в журнале Nature была опубликована статья, рассказывающая об успешном исправлении мутации в ДНК человеческого зародыша при помощи геномного редактора CRISPR/Cas9. Возможность устранения ошибок в геноме ведет к абсолютно новой ситуации, которая разворачивается на наших глазах.
    1015
  • 23/08/2018

    Российские ученые исследуют гены опасного поведения

    ​Новое исследование российских генетиков поможет объяснить и предупредить возникновение агрессивного поведения. Эти сведения нужны для понимания механизмов влияния генов на проявление характера и поступки.
    549
  • 20/05/2019

    Самую полезную рыбу в мире предложили разводить на фермах

    ​16 мая в рамках дискуссионного клуба в Проектном офисе развития Арктики ("ПОРА") ученые из Сибирского федерального университета рассказали о том, почему боганидский голец — еда будущего. Боганидский голец (палия) Salvelinus boganidae обитает в некоторых заповедных озерах Таймыра.
    98
  • 30/10/2018

    Ученые из РФ, Египта и Германии предложили простой способ определения пола финиковых пальм

    ​Ученый Сибирского федерального университета (СФУ) совместно с коллегами из Египта и Германии выявили молекулярные маркеры (ДНК- маркеры), которые позволили им определить пол финиковых пальм на стадии саженцев, что необходимо для успешной культивации этих растений.
    471
  • 21/01/2019

    Ученые исследовали биологическую активность углеродных наноструктур

    ​​Ученые Института биофизики Сибирского отделения Российской академии наук и Сибирского федерального университета исследовали биологическую активность углеродных наноструктур искусственного и естественного происхождения.
    799
  • 29/01/2019

    Выявлены ассоциации генов, связанных с адаптацией ладанной сосны к окружающей среде

    Биологи Сибирского федерального университета (СФУ) вместе с коллегами из США, Канады и Германии изучили генетическую основу устойчивости ладанной сосны к засухе. &13; Ладанная сосна - один из наиболее экономически значимых видов хвойных, ее древесину используют в разных областях промышленности.
    262