LifeCode-2018 прошел в Технопарке Академгородка. Непосредственно перед ним в НГУ была проведена Школа молодых ученых "Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул": больше половины участников хакатона посетили ее, что позволило им узнать о современных компьютерных методах в биологии и познакомиться друг с другом. На Школе были лекции и практикумы специалистов, а также стендовые и устные доклады участников - студентов, аспирантов и молодых ученых из разных городов.

На хакатоне LifeCode-2018 участникам было представлено несколько задач из разных областей биоинформатики. Каждая команда выбрала задачу себе по вкусу, и почти двое суток работала над ее решением. В конце мероприятия команды показали презентации своих работ. Жюри, состоящее из ученых и представителей бизнеса, выбрало победителей, которые получили подарки и денежные призы. Но г лавным результатом хакатона является то, что спустя три месяца многие команды продолжают развивать свои проекты.

Представитель команды, занявшей перовое место Иван Петрушин рассказал, что узнал о хакатоне и школе еще в феврале, когда первый раз участвовал в школе по биоинформатике в НГУ, посвященной геному человека. Его команда выбрала актуальную для Новосибирской области задачу - подбор ингибиторов белков вируса клещевого энцефалита с помощью докинга. Проект сейчас продолжается совместно с сотрудниками ГНЦ ВБ "Вектор", планируется экспериментальная проверка влияния найденных ингибиторов на вирус.

- Очень интересна оказалась тема моделирования биополимеров, взаимодействия их с малыми молекулами, что часто необходимо при дизайне лекарств. Лекторы школы познакомили с важными инструментами: Discovery Studio Visualizer, PyRx и UGENE. Особенно интересно было пообщаться непосредственно с разработчиками UGENE. Доклады участников здорово развили кругозор по теме, заставили взглянуть по-новому на некоторые методики. Хакатон - это отличный шанс поработать над реальной задачей, получить навык командной работы, почувствовать атмосферу драйва и увлеченности. Часто работа на хакатоне становится началом совместной работы, что порой важнее призов, - говорит Иван Петрушин.

Команда, занявшая второе место, решала задачу о разпознавании изображений, получающихся при анализе повреждений ДНК методом ДНК-комет. Дальнейшая работа над проектом идет совместно с норвежской компанией NorGenoTech, которая предложила эту задачу на хакатон и предоставила изображения для анализа.

- После хакатона я начала исследовать возможности программы 3Д-моделирования Blender по работе с пространственными структурами белков. Мое решение задачи по укладке амилоидных фибрилл, которое я представила на хакатоне, было еще предварительным. Сейчас я на планирую все сделать на более высоком уровне, и надеюсь, что вместе с товарищами по команде мы опубликуем статью, - отметила Зинаида Радькова, одна из участниц LifeCode-2018.

Команда, занявшая третье место, выбрала темой своего проекта работу с базой данных сплайсинговых вариантов белков. Автор задачи, Нина Опарина, работает в Стокгольмском университете. В начале июля она приезжала в Новосибирск и встретилась с участниками хакатона, чтобы обсудить развитие разработанного ими веб-сервиса и подготовку публикации в научный журнал.

Мероприятие проходило при поддержке Проекта 5-100.

Источники

Призеры хакатона LifeCode-2018 активно работают над проектами, представленными на мероприятии
Новосибирский государственный университет (nsu.ru), 20/08/2018

Похожие новости

  • 22/07/2016

    Выпускница из Новосибирска создала модуль для жертв чрезвычайных ситуаций

    ​Выпускница Новосибирского государственного университета архитектуры, дизайна и искусств Мария Ким разработала специальный модуль для временного размещения жертв чрезвычайных ситуаций.Мария создала замену обычной и более дешевой брезентовой палатке, которые сегодня предоставляют пострадавшим в чрезвычайных ситуациях людям.
    959
  • 29/08/2018

    Новосибирский опыт обучения детей инженерным наукам распространят на сибирские регионы

    ​Опыт новосибирских ученых и преподавателей в обучении школьников инженерным наукам собираются распространить на соседние регионы Сибири в течение ближайшего года. Об этом в среду на площадке Международного форума технологического развития "Технопром-2018" рассказал Иван Поликарпов, заведующий лабораторией факультета информационных технологий Новосибирского государственного университета (НГУ) "Инжевика".
    97
  • 25/07/2018

    Илон Маск по-сибирски

    ​В США компания Tesla создала крупный накопитель электроэнергии для целой страны. В России ученые НГТУ тоже изобрели накопитель для крупных предприятий - могут сделать и для Австралии, если попросят. Но их объединяют не только общая сфера деятельности, но и финансовые трудности.
    151
  • 20/09/2017

    Эффективная утилизация и переработка отходов в пищевой индустрии

    ​Руководитель Исследовательского центра продовольственной безопасности НГУ Юлия Отмахова опубликовала результаты комплексного научного исследования, позволяющие оценить экономический эффект и экологические последствия смоделированных вариантов утилизации отходов пищевых производств в условиях масштабного роста объемов пищевого производства.
    496
  • 25/07/2018

    Новосибирский школьник изобрел гальваническую электростанцию

    ​Ученик специализированного учебно-научного центра Новосибирского государственного университета изобрел гальваническую электростанцию. Школьнику удалось разработать механизм, позволяющий вырабатывать недорогую электроэнергию при помощи воды.
    205
  • 11/09/2017

    Сибирские изобретатели разрабатывают устройство, позволяющее читать эмоции людей

    Представьте картину из будущего: встаете утром, надеваете на руку браслет, а он не просто считает ваш пульс (это и сегодня никого не удивляет), но еще и распознает ваши же эмоции. Прожили день, взглянули на гаджет и поняли, что сегодня слишком много грустили, раз чего-то испугались, на кого-то разозлились - эти данные в режиме реального времени можно передать кому угодно.
    403
  • 29/08/2016

    В Новосибирске будут производить шагающие экзоскелеты для инвалидов

    ​Заместитель генерального директора по инновационному развитию "Инновационного медико-технологического центра" (Новосибирского медтехнопарка) Анатолий Аронов на круглом столе в рамках форума "Новосибирск- город безграничных возможностей" рассказал, что будут производить резиденты второй очереди медицинского промышленного парка.
    1904
  • 30/06/2017

    В Новосибирске создали легкий и мощный транспорт для мегаполиса

    ​Сибирские предприниматели изобрели новый вид транспорта, чтобы продемонстрировать прочность и легкость углеводородных нанотрубок. Владельцы-основатели компании OCSiAl - завкафедрой нанокомпозитных материалов Новосибирского госуниверситета Михаил Предтеченский и выпускник НГУ Юрий Коропачинский - придумали смартджет: нечто среднее между скутером, велосипедом и айфоном.
    721
  • 24/07/2018

    О путях развития региональной энергетики

    Наверное, сегодня уже никто не будет спорить с тем, что создание мини-электростанций и перевод газовых котельных в режим комбинированной выработки тепла и электричества – один из основных путей развития региональной энергетики.
    129
  • 27/03/2017

    Новосибирские ученые создали материал, обеспечивающий 30 лет непрерывной работы химического реактора

    Ученые из Института ядерной физики (ИЯФ) СО РАН и Новосибирского государственного технического университета (НГТУ) создали новую технологию сплавления титана и тантала, в результате чего получили особо стойкий к коррозии и агрессивным средам материал.
    1314