В Новосибирском госуниверситете прошел хакатон по биоинформатике LifeCode-2017. В соревновании приняло участие десять команд.

- Хакатон - это мероприятие, во время которого участники, объединившись в команды, создают проекты на определенную тему. В Новосибирске уже неоднократно проводились хакатоны для разработчиков программного обеспечения, но впервые в нашем городе темой стала биоинформатика, - рассказывает заведующая лабораторией структурной биоинформатики и молекулярного моделирования НГУ Анастасия Бакулина.

Организаторами хакатона LifeCode-2017 выступает САЕ "Синтетическая биология" и лаборатория структурной биоинформатики и молекулярного моделирования ФЕН НГУ.

В хакатоне приняло участие 50 человек, из которых были сформированы 10 команд. В течение двух дней им предстояло решить одну из предложенных экспертами задач и подготовить доклад о результатах. Задачи были предоставлены как научными лабораториями, так и коммерческими организациями. Все задачи были посвящены актуальным вопросам: предсказание свойств белков, разработка новых лекарственных препаратов, создание новых методов диагностики заболеваний.

Задачи для хакатона формулировали: компания "Новые программные системы", лаборатория иммунохимии ГНЦ ВБ "Вектор", Vall d'Hebron Research Institute, компания "БиоЛинк", биотехнологическая компания "Биокад", лаборатория геномной и белковой инженерии ИХБФМ СО РАН.

- Я рада, что наконец-то смогла побывать в Новосибирском Академгородке. На мероприятии мне удалось получить опыт по организации командной деятельности при работе над практическим проектом - в таком режиме как на хакатоне любые недостатки в этой сфере чувствуются очень остро. Кроме того, я получила опыт работы с BioPython и Ugene и узнала детали биологии флавивирусов, - говорит участница хакатона Татьяна Мамонтова, магистрант 1-го курса биологического факультета СПбГУ.

Работы оценивались учеными и представителями биоинформатических компаний Академгородка. Победители получили денежные призы.

- Хакатон оказался интересным и полезным мероприятием. Во-первых, удалось узнать о конкретных проблемах, которые могут быть решены методами биоинформатики. Во-вторых, используя свои знания, получилось эффективно решить проблему заказчиков. И, в-третьих, узнал о новых биоинформатических методах и подходах, - говорит участник команды-победителя хакатона Андрей Кечин, аспирант НГУ, сотрудник ИХБФМ СО РАН.

Первое место в хакатане за проект по поиску мутаций в белке BRCA1 при раке молочной железы заняла команда в составе:

Вибе Даниил Станиславович (выпускник ФЕН НГУ 2015 года)

Кечин Андрей Андреевич (выпускник ФЕН НГУ 2013 года, аспирант НГУ)

Оскорбин Игорь Петрович (выпускник ФЕН НГУ 2013 года)

Пахомов Евгений Дмитриевич

Устьянцев Кирилл Валерьевич (выпускник ФЕН НГУ 2014 года)

Шарапов Содбо Жамбалович (выпускник ФЕН НГУ 2014 года, аспирант НГУ)

Полный список победителей доступен hackathon_info.

Подробности об этом и следующем хакатонах можно узнать на сайте.

Источники

В НГУ прошел хакатон по биоинформатике LifeCode-2017
Новосибирский государственный университет (nsu.ru), 15/05/2017

Похожие новости

  • 26/06/2016

    Форум «Биомедицина-2016»

    С 26 июня по 1 июля в Новосибирске проходит форум «Биом​едицина-2016». ​В настоящее время биомедицинская наука преодолевает порог нового синтеза знаний, который ведет к формированию медицины нового поколения.
    2342
  • 01/12/2016

    На Международной биологической универсиаде студенты НГУ заняли призовые места

    ​Студенты факультета естественных наук Новосибирского государственного университета заняли призовые места на Международной биологической универсиаде. В секции «Экология, биотехнология растений и микроорганизмов» студенты взяли диплом второй степени.
    425
  • 15/10/2016

    Александр Карлин - о развитии инноваций на территории Алтайского края

    ​Одним из важных направлений работы по формированию региональной инновационной системы является создание и развитие на территории региона инфраструктуры для коммерциализации научных разработок и технологической модернизации в регионе.
    890
  • 16/08/2016

    Новые открытия и находки российско-германской ботанической экспедиции

    ​В начале августа 2016 года состоялась очередная совместная Российско-германская экспедиция, организованная Южно-Сибирским ботаническим садом АлтГУ под руководством профессора А.И. Шмакова.   На этот раз внимание ботаников было обращено к флоре территории Восточного Казахстана как части Алтайской горной страны.
    778
  • 17/10/2016

    Студенты НГУ - победители Всероссийского БиоТурнира

    ​Студенты факультета естественных наук Новосибирского государственного университета одержали победу на III Всероссийском БиоТурнире — командном соревновании студентов-биологов.  Мероприятие проходило в наукограде Пущино на базе Институтов биофизики клетки и теоретической и экспериментальной биофизики РАН.
    685
  • 31/05/2017

    Интерн НГУ получила премию им. Ю.Н. Соколова по лучевой диагностике

    ​23-25 мая 2017 года в Москве состоялся XI Всероссийский национальный конгресс лучевых диагностов и терапевтов «Радиология-2017».  «Радиология» на данный момент является самым популярным и масштабным медицинским мероприятием по лучевой диагностике в нашей стране.
    214
  • 04/07/2016

    Сибирские ученые исследуют морского ежа

    ​Учёные из лаборатории геномных технологий и лаборатории защитно-репарационных систем Новосибирского государственного университета (стратегическая академическая единица «Синтетическая биология») и Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с коллегами из Тихоокеанского института биоорганической химии ДВО РАН впервые изучили, как личинки морского ежа отвечают на факторы, повреждающие их гены.
    936
  • 22/09/2016

    В Новосибирске планируют создать клинику для лечения методом БНЗТ

    ​Новосибирский государственный университет в сотрудничестве с российскими и зарубежными научными организациями работает над реализацией масштабного проекта по созданию клиники для лечения глиобластомы мозга и других онкологических заболеваний с помощью метода бор-нейтронозахватной терапии и ускорительного источника нейтронов Института ядерной физики им Г.
    1058
  • 02/11/2016

    XXI Международная экологическая студенческая конференция прошла в НГУ

    ​28-30 октября в НГУ прошла Международная экологическая студенческая конференция (МЭСК-2016). Это мероприятие, ставшее доброй традицией, ежегодно собирает около двухсот студентов из разных регионов России и ближнего зарубежья.
    1150
  • 08/08/2017

    Ученые установили, что древние жители Алтая выращивали гигантских овец

    Ученые из Алтайского государственного университета (АлтГУ) совместно со специалистами из Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН подготовили и осуществили палеогенетические исследования костных останков овец, обнаруженных на юге Западной Сибири при раскопках археологических памятников, которые датируются с помощью радиоуглеродного метода второй половиной III – началом II тыс.
    112