По результатам международного конкурса Brain Tumor Segmentation (BraTS) Challenge — 2020 (Сегментация опухоли головного мозга) мультидисциплинарная команда из новосибирских ученых, в состав которой вошли научные сотрудники лаборатории аналитики потоковых данных и машинного обучения Механико-математического факультета НГУ, практикующие врачи Федерального центра нейрохирургии и руководитель Научно-исследовательского института клинической и экспериментальной лимфологии — филиала ИЦиГ СО РАН, получила подтверждение и признание разрабатываемых методов и подходов анализа медицинских данных в виде публикации.
 
Соревнование BraTS проводится уже несколько лет и специализируется на глиомах высокой и низкой степени злокачественности (HGG и LGG). В этом году в рамках конкурса были поставлены задачи: cегментация опухолей головного мозга; прогнозирование общей выживаемости пациентов на основе предоперационных МРТ-томограмм; оценка мер неопределенности при сегментации. 
 
— Наша команда «NSU_BTR» сфокусировалась на первой и третьей задачах. В ходе работ мы провели более 100 экспериментов. Использовались собственные оригинальные методы, в основе которых лежит подход к обработке МРТ-снимков, использующий основные последовательности Т1-ВИ, Т1-контраст, T2-ВИ и T2-Flair. Основная цель участия в международных соревнованиях — сравнение с лучшими практиками и проверка собственных подходов, — отметил заведующий лабораторией аналитики потоковых данных и машинного обучения ММФ НГУ Баир Тучинов
 
По итогам соревнования были получены положительные результаты на стадии валидации (проверки), и организаторы предложили команде НГУ опубликовать статью в издании Springer Nature. Полученный опыт и наработки используются в основном научном проекте «Разработка технологии персонализированной диагностики и выработки рекомендаций по лечению нейроонкологических заболеваний с применением методов нейровизуализации на основе систем искусственного интеллекта (глубокого машинного обучения)», поддержанным РФФИ
 
На данный момент по результатам выполнения проекта опубликовано 7 статей и еще 3 находятся в процессе рецензирования. 

 
— Текущие результаты можно использовать для персонализированной диагностики: раннего обнаружения и классификации новообразований, прогнозирования состояний и выборе тактики лечения, — комментирует руководитель проекта — известный радиолог, доктор медицинских наук, профессор Андрей Летягин.
 
***
Brain Tumor Segmentation and Associated Uncertainty Evaluation Using Multi-sequences MRI Mixture Data Preprocessing (Сегментация опухоли головного мозга и оценка связанной с ней неопределенности с использованием предварительной обработкой смешанных данных нескольких МРТ-последовательностей). 

Похожие новости

  • 20/02/2020

    Ученые показали генетическую связь процессов гликозилирования и опасных болезней человека

    ​Целью исследования, опубликованного в журнале Science Advances, был поиск генов, влияющих на гликозилирование иммуноглобулина G (IgG). Иммуноглобулины — это белки, которые играют роль телохранителей в человеческой иммунной системе.
    2735
  • 03/02/2021

    Программа мероприятий, посвященных Дню российской науки

    ​Ежегодно 8 февраля российское научное сообщество отмечает свой профессиональный праздник — День российской науки. ​ По традиции к этой дате в институтах и вузах, находящихся под научно-методическим руководством Сибирского отделения РАН, приурочены научно-популярные мероприятия: дни открытых дверей, экскурсии, лекции и так далее.
    2313
  • 03/03/2021

    Учёный НГУ создал нейросеть для газоанализатора, помогающего выявлять коронавирус

    Один из способов оперативной диагностики состояния организма разработан учеными Института автоматики и электрометрии СО РАН совместно с компанией ScientificCoin. С помощью созданного ими газоанализатора Healthmonitor можно с точностью до 85 % определить наличие в организме коронавирусной инфекции.
    692
  • 28/06/2021

    В Новосибирске обсудят этику применения искусственного интеллекта в медицине и здравоохранении

    ​​​1 июля 2021 года на базе Точки кипения НГТУ НЭТИ состоится круглый стол «Новая медицинская парадигма: изменение роли врача и пациента (Этические вопросы применения технологий АI и генной инженерии в сфере здравоохранения)».
    463
  • 23/10/2019

    Новосибирские биоинформатики разработали уникальный программный комплекс

    ​Сотрудники ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН», Новосибирского государственного университета и Университета им. Мартина Лютера (Германия) разработали программный комплекс, позволяющий повысить эффективность анализа дорогостоящих геномных экспериментов.
    1381
  • 12/07/2017

    Сибирские и немецкие ученые разработали новый метод анализа данных в биоинформатике

    ​​Лаборатория компьютерной транскриптомики и эволюционной биоинформатики ФЕН НГУ совместно с коллегами из Института цитологии и генетики СО РАН и Галле-Виттенбергского университета им.
    2134
  • 29/04/2021

    В ТюмГУ подвели итоги научно-исследовательской деятельности в 2020 году

    На апрельском Учёном совете ТюмГУ первый проректор Андрей Толстиков представил результаты научно-исследовательской деятельности университета в 2020 году и результаты участия ТюмГУ в составе Западно-Сибирского межрегионального научно-образовательного центра (НОЦ).
    492
  • 22/06/2020

    Институт генетических технологий появится в структуре НГУ

    ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН» совместно с Новосибирским государственным университетом выступили организаторами Института генетических технологий НГУ. Его задачами станут подготовка кадров высшей квалификации по направлению «геномные исследования и генетические технологии», а также реализация совместных научно-исследовательских проектов.
    1498
  • 29/07/2021

    Новосибирский карбоновый полигон станет выпускать углеродные кредиты

    Карбоновая ферма, которую планируют создать на базе карбонового полигона Новосибирского государственного университета (НГУ), будет выпускать углеродные кредиты - сертификаты, дающие право на выброс углекислого газа, сообщил 28 июля в пресс-центре ТАСС проректор по научно-исследовательской деятельности Новосибирского государственного университета Дмитрий Чуркин.
    931
  • 13/11/2019

    Томские ученые научили компьютерную модель выявлять рак простаты

    ​Ученые лаборатории биофотоники ТГУ совместно с онкологами ТНИМЦ разработали новый подход к диагностике аденокарциномы — злокачественной опухоли предстательной железы. Для выявления онкопатологии и определения стадии заболевания в данном подходе используется искусственный интеллект.
    1052