По результатам международного конкурса Brain Tumor Segmentation (BraTS) Challenge — 2020 (Сегментация опухоли головного мозга) мультидисциплинарная команда из новосибирских ученых, в состав которой вошли научные сотрудники лаборатории аналитики потоковых данных и машинного обучения Механико-математического факультета НГУ, практикующие врачи Федерального центра нейрохирургии и руководитель Научно-исследовательского института клинической и экспериментальной лимфологии — филиала ИЦиГ СО РАН, получила подтверждение и признание разрабатываемых методов и подходов анализа медицинских данных в виде публикации.
 
Соревнование BraTS проводится уже несколько лет и специализируется на глиомах высокой и низкой степени злокачественности (HGG и LGG). В этом году в рамках конкурса были поставлены задачи: cегментация опухолей головного мозга; прогнозирование общей выживаемости пациентов на основе предоперационных МРТ-томограмм; оценка мер неопределенности при сегментации. 
 
— Наша команда «NSU_BTR» сфокусировалась на первой и третьей задачах. В ходе работ мы провели более 100 экспериментов. Использовались собственные оригинальные методы, в основе которых лежит подход к обработке МРТ-снимков, использующий основные последовательности Т1-ВИ, Т1-контраст, T2-ВИ и T2-Flair. Основная цель участия в международных соревнованиях — сравнение с лучшими практиками и проверка собственных подходов, — отметил заведующий лабораторией аналитики потоковых данных и машинного обучения ММФ НГУ Баир Тучинов
 
По итогам соревнования были получены положительные результаты на стадии валидации (проверки), и организаторы предложили команде НГУ опубликовать статью в издании Springer Nature. Полученный опыт и наработки используются в основном научном проекте «Разработка технологии персонализированной диагностики и выработки рекомендаций по лечению нейроонкологических заболеваний с применением методов нейровизуализации на основе систем искусственного интеллекта (глубокого машинного обучения)», поддержанным РФФИ
 
На данный момент по результатам выполнения проекта опубликовано 7 статей и еще 3 находятся в процессе рецензирования. 

 
— Текущие результаты можно использовать для персонализированной диагностики: раннего обнаружения и классификации новообразований, прогнозирования состояний и выборе тактики лечения, — комментирует руководитель проекта — известный радиолог, доктор медицинских наук, профессор Андрей Летягин.
 
***
Brain Tumor Segmentation and Associated Uncertainty Evaluation Using Multi-sequences MRI Mixture Data Preprocessing (Сегментация опухоли головного мозга и оценка связанной с ней неопределенности с использованием предварительной обработкой смешанных данных нескольких МРТ-последовательностей). 

Похожие новости

  • 12/07/2017

    Сибирские и немецкие ученые разработали новый метод анализа данных в биоинформатике

    ​​Лаборатория компьютерной транскриптомики и эволюционной биоинформатики ФЕН НГУ совместно с коллегами из Института цитологии и генетики СО РАН и Галле-Виттенбергского университета им.
    1953
  • 20/02/2020

    Ученые показали генетическую связь процессов гликозилирования и опасных болезней человека

    ​Целью исследования, опубликованного в журнале Science Advances, был поиск генов, влияющих на гликозилирование иммуноглобулина G (IgG). Иммуноглобулины — это белки, которые играют роль телохранителей в человеческой иммунной системе.
    2195
  • 22/06/2020

    Институт генетических технологий появится в структуре НГУ

    ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН» совместно с Новосибирским государственным университетом выступили организаторами Института генетических технологий НГУ. Его задачами станут подготовка кадров высшей квалификации по направлению «геномные исследования и генетические технологии», а также реализация совместных научно-исследовательских проектов.
    1280
  • 03/03/2021

    Учёный НГУ создал нейросеть для газоанализатора, помогающего выявлять коронавирус

    Один из способов оперативной диагностики состояния организма разработан учеными Института автоматики и электрометрии СО РАН совместно с компанией ScientificCoin. С помощью созданного ими газоанализатора Healthmonitor можно с точностью до 85 % определить наличие в организме коронавирусной инфекции.
    349
  • 23/10/2019

    Новосибирские биоинформатики разработали уникальный программный комплекс

    ​Сотрудники ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН», Новосибирского государственного университета и Университета им. Мартина Лютера (Германия) разработали программный комплекс, позволяющий повысить эффективность анализа дорогостоящих геномных экспериментов.
    1185
  • 03/02/2021

    Программа мероприятий, посвященных Дню российской науки

    ​Ежегодно 8 февраля российское научное сообщество отмечает свой профессиональный праздник — День российской науки. ​ По традиции к этой дате в институтах и вузах, находящихся под научно-методическим руководством Сибирского отделения РАН, приурочены научно-популярные мероприятия: дни открытых дверей, экскурсии, лекции и так далее.
    1017
  • 13/11/2019

    Томские ученые научили компьютерную модель выявлять рак простаты

    ​Ученые лаборатории биофотоники ТГУ совместно с онкологами ТНИМЦ разработали новый подход к диагностике аденокарциномы — злокачественной опухоли предстательной железы. Для выявления онкопатологии и определения стадии заболевания в данном подходе используется искусственный интеллект.
    904
  • 19/08/2016

    Из студентов НГУ - в преподаватели биоинформатики

    ​Школа довузовской подготовки факультета информационных технологий НГУ в новом учебном году расширяет работу со школьниками — появляются занятия со старшеклассниками в рамках создаваемой Научно-технической проектной лаборатории НГУ «Инжевика».
    3348
  • 10/10/2018

    Генетики расшифруют молекулярные основы болезней сердца

    ​Ученые из новосибирского Академгородка и Эдинбурга (Великобритания) планируют найти новые биомаркеры и мишени для лекарств при сердечно-сосудистых заболеваниях, а также разработать методы прогнозирования риска болезни.
    1496
  • 15/04/2021

    Алгоритм учёных ТГУ поможет быстрее диагностировать опухоли щитовидки

    Исследователи из 10 ведущих научных центров России, среди которых ТГУ, МГУ, НГУ, НИЦ «Курчатовский институт», ИЛФ РАН, ИПЛИТ РАН и другие, в рамках комплексного проекта РФФИ разработали новый подход к диагностике опухолей щитовидной железы, основанный на анализе крови.
    200