​Учёные МГУ создали базу данных веществ, подавляющих белковый синтез – потенциальных лекарств для борьбы с раком и вирусными инфекциями.

Биосинтез белка – один из главных метаболических процессов, жизненно необходимый для поддержания всех функций нашего организма. В активно делящихся клетках на него расходуется существенная часть энергии, а его нарушение приводит к неизбежной остановке деления и клеточной смерти. Поэтому неудивительно, что трансляция (как ещё называют биосинтез белка)  является «ахиллесовой пятой», например, опухолевых клеток. То же самое можно сказать и о вирусах, заставляющих клетку активно нарабатывать свои белки. Разумеется, паразитические бактерии в активной стадии роста также сильно зависят от трансляции. Поэтому низкомолекулярные вещества-ингибиторы, способные специфично подавлять биосинтез белка, имеют большое значение для борьбы с раком, вирусными и бактериальными инфекциями. Но их применение не ограничивается этими областями: они используются в противовоспалительной, иммуносупрессорной и антигрибковой терапии, в неврологии, паразитологии и гериатрии, в лечении наследственных заболеваний, в решении задач продления жизни, а также в сельском хозяйстве и ветеринарии. Тем не менее, в медицине их применение пока сильно ограничено из-за побочных эффектов, вызываемых токсичностью этих препаратов. Однако быстрое развитие технологий высокопроизводительного скрининга, компьютерного моделирования и машинного обучения в сочетании с современными методами структурного анализа и химического синтеза позволяет надеяться на быстрый прогресс в разработке новых производных с усовершенствованными терапевтическими свойствами.

Разработка новых ингибиторов невозможна без систематизации знаний об уже открытых веществах с такой активностью. Про антибиотики, подавляющие синтез белка у бактерий, написаны многочисленные научные обзоры и монографии. А вот ингибиторы трансляции в клетках эукариот (организмов, чья клетка имеет ядро – таких, как животные, растения, грибы и простейшие) почему-то оказались незаслуженно обойдены вниманием, хотя именно на них во многом возлагаются надежды в вышеперечисленных областях медицины. Коллектив авторов из МГУ под руководством Сергея Дмитриева решил исправить эту «несправедливость» и издал «Краткий справочник по низкомолекулярным ингибиторам эукариотической трансляции» на русском и английском языках. «Справочник» вышел в виде таблиц и обзора, которые были опубликованы в тематическом номере журнала «Биохимия», посвящённом юбилею академика Алексея Алексеевича Богданова – классика, внесшего большой вклад в изучение механизмов биосинтеза белка.

В этом обзоре мы попытались упомянуть основные типы низкомолекулярных ингибиторов эукариотической трансляции, – рассказывает соавтор статьи, студент 2 курса факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ Дэн Владимиров. – Однако количество известных на данный момент веществ с подобной активностью, даже если рассматривать лишь ингибиторы с хорошо охарактеризованным механизмом действия, составляет несколько сотен, поэтому рассмотреть их все в рамках одной статьи не представлялось возможным. Кроме того, этот список постоянно пополняется новыми веществами. Поэтому, помимо таблиц и текста, нами была разработана обновляемая база данных низкомолекулярных ингибиторов биосинтеза белка. Мы дали ей забавное название «EuPSIC» (звучит как «Юпсик» – сокращение от английского «Eukaryotic Protein Synthesis Inhibiting Compounds»). В ней содержатся дополнительные поля, облегчающие машинную обработку данных – такие как идентификаторы веществ из базы данных химических соединений PubChem, ссылки на литературные источники и так далее.

База данных размещена на сайте НИИ физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского МГУ: 

http://eupsic.belozersky.msu.ru/.

Пресс-служба МГУ

Похожие новости

  • 04/12/2020

    Электронный атлас абразионной и ледово-экзарационной опасности прибрежно-шельфовой зоны Российской Арктики

    ​​Географы МГУ имени М.В. Ломоносова завершили работу над бета-версией "Электронного атласа абразионной и ледово-экзарационной опасн​​​ости прибрежно-шельфовой зоны Российской Арктики". В атласе можно найти карты, аналитические и фотоматериалы, иллюстрирующие распространение абразии и ледовой экзарации — крайне опасных процессов для человеческой деятельности в Арктике.
    661
  • 24/03/2021

    Учёные Кемеровского госуниверситета работают над созданием геоинформационной системы Тепсейского археологического микрорайона

    Археологи Кемеровского государственного университета в рамках исполнения гранта РФФИ «Наскальное искусство Тепсейского микрорайона в контексте археологических материалов» продолжают исследовать микрорайон, локализованный в Минусинской котловине в Краснотуранском районе Красноярского края, с целью формирования представлений о культурно-историческом пространстве.
    319
  • 01/02/2021

    Оставить Россию без науки — обречь её на гибель

    ​​В 2013 году российское руководство пошло на шаг, казавшийся невообразимым ни при каких условиях. Существовавшая более трех столетий Российскую академию наук лишили средств на финансирование институтов, а сами институты были фактически выведены из подчинения РАН: было учреждено Федеральное агентство научных организаций (ФАНО), которому передали от Академии наук функции держателя средств на науку и контроль за научной деятельностью институтов.
    385
  • 20/10/2020

    Более 15 млн участников: XV юбилейный Всероссийский фестиваль NAUKA 0+ завершился рекордами

    ​18 октября в Москве завершился столичный этап юбилейного Всероссийского фестиваля NAUKA 0+, который в этом году прошёл онлайн и за 5 дней собрал рекордное количество участников – более 15 млн пользователей со всего мира стали гостями крупнейшего научно-популярного события.
    553
  • 12/05/2021

    1 миллион наблюдений за дикорастущими растениями страны собрал проект МГУ «Флора России»

    Учёные биологического факультета МГУ в январе 2019 года запустили на международной платформе iNaturalist проект «Флора России», в котором может принять участие любой желающий. Для этого, пройдя несложную регистрацию, нужно загружать фотографии трав, деревьев и кустарников через сайт или приложение.
    202
  • 09/11/2020

    «Архипелаг 20.35»: треки томских вузов

    7 ноября более ста команд начали работу на треках, организованных ТГУ в рамках всероссийского онлайн-интенсива «Архипелаг 20.35». Они трудятся над проектами, в которых искусственный интеллект (ИИ, artificial intelligence, AI) применяется для развития образования, самореализации и повышения качества жизни человека,  управления беспилотниками.
    505
  • 08/08/2020

    «Академгородок 2.0» будут копировать и масштабировать

    ​​​Новосибирскую программу перезапуска развития территории с повышенной концентрацией науки и инноваций берут в другие регионы. Пожалуй, наиболее востребованная новость из недавней рабочей поездки в Новосибирск министра науки и высшего образования Валерия Фалькова была про увеличение бюджетных мест в вузах региона.
    1485
  • 09/11/2020

    Археологи ТГУ нашли по космоснимкам древние рудники в Горном Алтае

    ​​Сотрудники междисциплинарной археологической лаборатории «Артефакт» при поддержке РНФ изучают древние технологии добычи железа в Южной Сибири. В частности, они проводят исследования в Горном Алтае, где металлургия железа была развита уже в середине I тыс.
    649
  • 26/07/2019

    Российские ученые разработают алгоритм, позволяющий операторам связи делить сети 5G

    ​Специалисты Федерального исследовательского центра "Информатика и управление" и Института прикладной математики и телекоммуникаций РУДН планируют завершить исследования в 2021 году. Специалисты Федерального исследовательского центра "Информатика и управление" (ФИЦ ИУ РАН) и Института прикладной математики и телекоммуникаций Российского университета дружбы народов (РУДН) разрабатывают алгоритмы, с помощью которых операторы мобильной связи смогут в будущем делить радиоресурсы сетей 5G и сдавать их в аренду другим компаниям для повышения эффективности использования сетей и предоставления новых услуг.
    875
  • 14/12/2020

    «Айсберг» для климата: профессор ТПУ о метановых выбросах в Арктике

    ​​Ученые зафиксировали удвоение метановых выбросов в Арктике за год. При ускорении деградации мерзлоты огромное количество древнего метана может быть "перекачано" в атмосферу. Как предсказать климатические последствия этого, в интервью РИА Томск рассказал руководитель единственной международной экспедиции в Арктику 2020 года, профессор Томского политеха (ТПУ) Игорь Семилетов.
    529