В Новосибирском госуниверситете прошел хакатон по биоинформатике LifeCode-2017. В соревновании приняло участие десять команд.

- Хакатон - это мероприятие, во время которого участники, объединившись в команды, создают проекты на определенную тему. В Новосибирске уже неоднократно проводились хакатоны для разработчиков программного обеспечения, но впервые в нашем городе темой стала биоинформатика, - рассказывает заведующая лабораторией структурной биоинформатики и молекулярного моделирования НГУ Анастасия Бакулина.

Организаторами хакатона LifeCode-2017 выступает САЕ "Синтетическая биология" и лаборатория структурной биоинформатики и молекулярного моделирования ФЕН НГУ.

В хакатоне приняло участие 50 человек, из которых были сформированы 10 команд. В течение двух дней им предстояло решить одну из предложенных экспертами задач и подготовить доклад о результатах. Задачи были предоставлены как научными лабораториями, так и коммерческими организациями. Все задачи были посвящены актуальным вопросам: предсказание свойств белков, разработка новых лекарственных препаратов, создание новых методов диагностики заболеваний.

Задачи для хакатона формулировали: компания "Новые программные системы", лаборатория иммунохимии ГНЦ ВБ "Вектор", Vall d'Hebron Research Institute, компания "БиоЛинк", биотехнологическая компания "Биокад", лаборатория геномной и белковой инженерии ИХБФМ СО РАН.

- Я рада, что наконец-то смогла побывать в Новосибирском Академгородке. На мероприятии мне удалось получить опыт по организации командной деятельности при работе над практическим проектом - в таком режиме как на хакатоне любые недостатки в этой сфере чувствуются очень остро. Кроме того, я получила опыт работы с BioPython и Ugene и узнала детали биологии флавивирусов, - говорит участница хакатона Татьяна Мамонтова, магистрант 1-го курса биологического факультета СПбГУ.

Работы оценивались учеными и представителями биоинформатических компаний Академгородка. Победители получили денежные призы.

- Хакатон оказался интересным и полезным мероприятием. Во-первых, удалось узнать о конкретных проблемах, которые могут быть решены методами биоинформатики. Во-вторых, используя свои знания, получилось эффективно решить проблему заказчиков. И, в-третьих, узнал о новых биоинформатических методах и подходах, - говорит участник команды-победителя хакатона Андрей Кечин, аспирант НГУ, сотрудник ИХБФМ СО РАН.

Первое место в хакатане за проект по поиску мутаций в белке BRCA1 при раке молочной железы заняла команда в составе:

Вибе Даниил Станиславович (выпускник ФЕН НГУ 2015 года)

Кечин Андрей Андреевич (выпускник ФЕН НГУ 2013 года, аспирант НГУ)

Оскорбин Игорь Петрович (выпускник ФЕН НГУ 2013 года)

Пахомов Евгений Дмитриевич

Устьянцев Кирилл Валерьевич (выпускник ФЕН НГУ 2014 года)

Шарапов Содбо Жамбалович (выпускник ФЕН НГУ 2014 года, аспирант НГУ)

Полный список победителей доступен hackathon_info.

Подробности об этом и следующем хакатонах можно узнать на сайте.

Источники

В НГУ прошел хакатон по биоинформатике LifeCode-2017
Новосибирский государственный университет (nsu.ru), 15/05/2017

Похожие новости

  • 09/11/2017

    Опубликованы итоги конкурса проектов комплексных междисциплинарных фундаментальных научных исследований (Комфи) 2017 года

    На сайте Российского фонда фундаментальных исследований опубликованы итоги конкурса проектов комплексных междисциплинарных фундаментальных научных исследований «Молекулярные основы функционирования живых систем» (Комфи) 2017 года.
    698
  • 16/06/2016

    Стали известны имена 30 молодых учёных – обладателей премий мэрии Новосибирска

    ​​Координационный совет по поддержке деятельности молодых учёных под председательством мэра Новосибирска Анатолия Локтя определил имена победителей конкурса на соискание премий мэрии в сфере науки и инноваций для молодых учёных и специалистов.
    3977
  • 22/08/2016

    Дмитрий Кнорре - номинант конкурса «Лучшие имена немцев России - 2016»

    ​Предлагаем вашему вниманию биографию и список достижений Дмитрия Кнорре - номинанта конкурса "Лучшие имена немцев России - 2016" в области науки им. Бориса Раушенбаха. Дмитрий Георгиевич Кнорре - известный советский и российский ученый, специалист в области химической кинетики, основоположник исследований в области молекулярной биологии, биоорганической химии и биохимии в СО РАН, создатель Отдела биохимии в Новосибирском институте органической химии СО РАН и затем Новосибирском институте биоорганической химии СО РАН.
    1338
  • 05/05/2016

    Грант Президента РФ - для исследования системы репарации

    Сотрудники Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН получили грант Президента РФ, выиграв конкурс по государственной поддержке молодых российских ученых-кандидатов наук. Новосибирцы исследуют систему репарации ортопоксвирусов, чтобы найти вещества, которые способны подавлять жизненный цикл возбудителей болезней.
    1297
  • 21/02/2018

    Награды для победителей конкурса грантов от мэрии Новосибирска

    ​15 февраля в Доме ученых Академгородка состоялась традиционная встреча ведущих ученых СО РАН и выпускников школ под названием "Выбери профессию в науке". В ее рамках победители конкурса получили гранты от мэрии, а ведущие ученые СО РАН прочитали несколько лекций на актуальные темы.
    622
  • 15/05/2018

    Итоги совместного конкурса РФФИ - Японский фонд медицинских исследований 2018 года

    ​На конкурс было подано 8 заявок. По результатам экспертизы, проведенной независимо российской и японской стороной, поддержано 3 проекта. Код конкурса: (ЯМИФ_т) Совместный конкурс фундаментальных научных исследований РФФИ - Японский фонд медицинских исследований.
    298
  • 24/11/2017

    Студенты НГУ выиграли VII Международный турнир естественных наук

    ​Команда студентов Новосибирского государственного университета «Будем творить своими мозгами» одержала победу в VII Международном турнире естественных наук. Соревнования русскоязычной лиги проходили в Санкт-Петербурге.
    638
  • 25/11/2015

    В Москве прошла церемония вручения национальных стипендий L'ORÉAL-UNESCO "Для женщин в науке".

    ​23 ноября в Москве в Государственном музее изобразительных искусств имени А.С. Пушкина прошла I X ежегодная церемония вручения национальных стипендий L'ORÉAL-UNESCO "Для женщин в науке". Десяти молодым российским женщинам-ученым вручены стипендии, призванные помочь талантливым и перспективным специалистам в различных областях знаний развивать свою карьеру в России.
    2047
  • 19/12/2017

    Монография сотрудников НГУ «Основы биологической безопасности» заняла первое место на Всероссийском конкурсе

    ​По итогам II Всероссийского конкурса на лучшую научную и учебную публикацию «Академус» монография из НГУ «Основы биологической безопасности» стала лучшей в номинации «Здравоохранение».   В этом году на участие в конкурсе «Академус» было подано 702 заявки из всех регионов России.
    513
  • 13/02/2018

    Биологи НГУ победили на Студенческом биологическом турнире

    ​В МГУ имени М.В. Ломоносова завершился III Студенческий биологический турнир. Честь НГУ отстаивали две команды, и обе показали достойный результат. Команда «Секрет Дегенерации» заняла первое место, команда «Умственно усталые» – второе.
    561