​Продолжается знакомство с темами, которые будут обсуждаться на международной мультиконференции BGRS\SB'2018 в Новосибирске 20 - 25 августа 2018 года.

Сегодня практически все технологии, которые используются и в исследовательской биологии и клинической медицине опираются на компьютерную обработку и анализ данных. Мощность исследовательского оборудования и систем мониторинга растет в геометрической прогрессии. И вместе с ней растет объем получаемой исследователем информации. Еще несколько десятилетий назад первичным результатом МРТ исследования головного мозга был пакет файлов в сто килобайт и меньше, то сейчас для того, чтобы записать полный протокол такого исследования может не хватить DVD-диска. Рутинными материалами для исследователей стали видеоконтроль за подопытными животными, цветные микрофотографии с высоким разрешением, работа с цветовыми маркерами, видеофайлами и т.п. А в совокупности получается гигантский массив информации об объекте исследования, который с полным правом можно отнести к Big data.

- Но сейчас, когда на нас накатывается такой огромный объем данных, остро встает вопрос, как эту информацию быстро обрабатывать, корректно анализировать и потом синтезировать полученные данные в объективный результат, - отметил зам. директора ФИЦ "Институт цитологии и генетики СО РАН", руководитель НИИКЭЛ, д.м.н. Андрей Летягин.

Ученые признают, часто речь идет об информационных массивах, проанализировать которые в разумные сроки не под силу даже самому квалифицированному специалисту, требуется привлечение искусственного интеллекта. С другой стороны, такая обработка дает очень важные результаты, которые вызывают не только академический интерес, но и имеют сугубо практический характер.

Так, по результатам мониторинга уровня глюкозы в крови в течение нескольких суток были выявлены его провалы, которые происходят у ряда людей во время сна по определенным биологическим ритмам и даже могут повлечь внезапную смерть. Обладая такой информацией, врачи получают возможность купирования этой угрозы здоровью. И это только один из многих примеров тех возможностей, которые открываются перед медициной вместе с развитием систем диагностики и мониторинга состояния разных систем организма.

Вопросу инструментария для работы с Big data в области биомедицины и тем возможностям, которые при этом открываются для диагностики и лечения заболеваний, будет посвящено несколько докладов на SBIOMED-2018 - медицинском симпозиуме, проходящем в рамках BGRS-SP.

Сам Андрей Юрьевич расскажет о работе, которую он проводит вместе с коллегами по НИИКЭЛ по развитию возможностей лимфореовазографии. Реографией называют метод исследования пульсовых колебаний сосудов различных органов и тканей, основанный на графической регистрации изменений полного электрического сопротивления тканей в виде пульсовой кривой. Этот способ диагностики известен достаточно давно, но сейчас ученым занимаются его развитием, увеличивая объем получаемой информации.

На основе анализа данных (в том числе, косвенных), строится индивидуальная модель пульсовой кривой, для поиска среди ее характеристик различных биомаркеров.

- Основная наша цель: найти биомаркеры, которые характеризуют состояние лимфатической системы и лимфотока в определенной части организма пациента, - рассказал Андрей Летягин.

Эти параметры очень важны для выбора стратегии лечения такой патологии как лимфедема. Она проявляется в нарушениях оттока жидкости по лимфатическим сосудам, ведущим к нарастающим отекам мягких тканей пораженной области. Однако такие нарушения могут быть вызваны разными причинами и развиваться по разным механизмам, соответственно, и лечение их должно быть совершенно разным. В одном случае требуется физиотерапия, в другом - компрессионное бинтование, в третьем - воздействие на отдаленные лимфоузлы, в четвертом - затрагивать венозную систему и т.д. Еще больше усложняют картину участие в развитии заболевания различных генетически обусловленных и внешних факторов.

Распутать этот узел ученые рассчитывают с помощью разрабатываемой модели, где на основе найденных биомаркеров можно оценить происходящее на микроциркуляторном и клеточном уровнях. Зная механизм развития патологии в каждом конкретном случае, уже можно планировать индивидуализированную, правильную и наиболее эффективную стратегию лечения. Конечно, такая работа снова потребует обработки объемов информации, попадающих под определение Big data, а значит, в перспективе к ней надо будет привлекать системы искусственного интеллекта. А в результате, формируется та самая персонализированная медицина, о необходимости внедрения которой сегодня говорят повсеместно.

Напоминаем, что ведущие участники этого проекта примут участие в работе 11-ой Международной конференции по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology - BGRS\SB-2018), которая пройдет в новосибирском Академгородке 20 - 25 августа 2018 года. Там у журналистов будет возможность получить комментарии "из первых рук" и задать участникам проекта свои вопросы.

Пресс-служба ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН

Источники

"Цифровой фундамент" персонализированной медицины
Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук (bionet.nsc.ru), 15/08/2018
В Новосибирске ученые обсудят проблемы "цифрового фундамента" научной и клинической медицины
БезФормата.Ru Новосибирск (novosibirsk.bezformata.ru), 17/08/2018

Похожие новости

  • 27/10/2015

    В Академпарке открывается первая в России конференция по биомедицинской инженерии и вычислительным технологиям в биологии и медицине

    ​28 октября в Технопарке Новосибирского Академгородка стартует SIBIRCON/SibMedInfo - 2015 - крупнейшая конференция по биомедицинской инженерии, проводимая в России под эгидой международной ассоциации специалистов в области техники Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE).
    1815
  • 18/10/2017

    В Новосибирске прошла программа для молодых исследователей «Навигатор инноватора»

    В Технопарке Новосибирского Академгородка прошла выездная школа Открытого университета Сколково «Навигатор инноватора. Новосибирск». В течение 4 дней студенты, аспиранты и молодые ученые проходили основные стадии работы с технологическим проектом: разработка продукта, определение рынка и потребителей, защита интеллектуальной собственности, презентация проекта.
    506
  • 13/05/2017

    На форуме «Инфосибирь» обсудят актуальные вопросы развития информационных систем в сфере здравоохранения, образования и науки

     Утверждена программа IV межрегионального форума «Инфосибирь», который пройдет в Новосибирской области 17-18 мая. Эксперты из нескольких регионов страны обсудят ключевые вопросы развития информационных систем в сфере здравоохранения, образования и науки.
    816
  • 06/04/2018

    Города обзаводятся интеллектом

    Повышение качества жизни населения сибирского мегаполиса путем включения в его повседневность систем hi-tech стало темой обсуждения на пленарной сессии «Умные технологии: от идей к внедрениям» на международном форуме «Городские технологии―2018».
    474
  • 25/10/2017

    В Новосибирске на форуме «СибЭкоПром-2017» обсудят экологические проблемы

    ​23 ноября в Новосибирске пройдет II Сибирский эколого-промышленный форум «СибЭкоПром-2017». В обсуждении экологических проблем региона примут участие специалисты мэрии Новосибирска.
    855
  • 23/09/2016

    На Байкале состоялась Международная конференция Asia-Pacific EPR/ESR Symposium 2016

    ​В посёлке Листвянка Иркутской области прошла X международная конференция Asia-Pacific EPR/ESR Symposium 2016. APES 2016 — официальная конференция Азиатско-Тихоокеанского общества электронного парамагнитного резонанса (ЭПР), которая проводится каждые два года.
    2727
  • 19/05/2016

    Аспирантка НГУ - первая российская участница семинаров по цифровой гуманитаристике в Кембридже

    Аспирантка НГУ, сотрудница кафедры древних литератур и литературного источниковедения Ксения Грищенко приняла участие в курсе MMSDA-2016 (Manuscript Studies in the Digital Age 2016/Исследования рукописей в цифровую эпоху-2016).
    1766
  • 02/04/2018

    «Городские технологии-2018»: искусственный интеллект как инструмент для решения бизнес-задач

    ​В рамках III международного форума «Городские технологии» 5 и 6 апреля будет работать секция «Цифровая экономика». Участники дискуссии обсудят, как использование искусственного интеллекта скажется на эффективности решения бизнес-задач.
    469
  • 31/07/2018

    В Новосибирске пройдет международная конференция «BGRS\SB-2018»

    ​20-25 августа в новосибирском Академгородке пройдет 11- я международная мультиконференция "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology - "BGRS\SB-2018". Сегодня биоинформатика пользуется заслуженным интересом в мире науки.
    258
  • 29/06/2018

    В НГАСУ пройдет конференция по проблемам компьютерного моделирования в строительстве

    ​1 - 8 июля 2018 года в Новосибирске на базе Новосибирского государственного архитектурно-строительного университета (Сибстрин) пройдет крупнейшая в России конференция по проблемам компьютерного моделирования в строительстве - VII Международный симпозиум "Актуальные проблемы компьютерного моделирования конструкций и сооружений".
    358